卫生许可证是单位和个人从事食品生产及餐饮店的经营活动，经卫生行政部门审查批准后，发给的卫生许可凭证，有注册备案的许可证号。餐饮服务许可证即中国餐饮行业的经营许可证，是根据2009年6月1日开始施行的食品安全法，中国6月1日起正式启用的餐饮服务许可证，取代已沿用了几十年的食品卫生许可证。食品流通许可证是对食品流通许可证的发放、发放条件、发放程序以及与食品卫生许可证的衔接等问题予以明确。对食品经营者必须坚持先证后照，未取得前置审批文件，不得办理注册登记手续。国家对食品生产经营实行许可制度。从事食品生产、食品流通、餐饮服务的单位或个人，应当依法取得食品生产许可、食品流通许可、餐饮服务许可。
1、2015年10月1日食药局发布的《食品经营许可管理办法》正式实施，食品流通许可和餐饮许可合并为食品经营许可，也就是说食品经营许可证代替食品流通许可证。两者的区别在于食品流通许可证是旧的，已经废止。2、《食品经营许可管理办法》规定在中华人民共和国境内，从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。3、食品流通许可证，是对食品流通许可证的发放、发放条件、发放程序以及与食品卫生许可证的衔接等问题予以明确。对食品经营者必须坚持先证后照，未取得前置审批文件，不得办理注册登记手续。4、2015年11月10日，国家工商行政管理总局发布关于废止《流通环节食品安全监督管理办法》和《食品流通许可证管理办法》的决定（国家工商行政管理总局令第79号），决定废止《食品流通许可证管理办法》（2009年7月30日国家工商行政管理总局令第44号）。
有关被吊销许可证的食品生产经营者的司法解释，新的《食品生产许可管理办法》（国家食品药品监督管理总局令第16号）中规定：第五十一条许可申请人隐瞒真实情况或者提供虚假材料申请食品生产许可的，由县级以上地方食品药品监督管理部门给予警告。申请人在1年内不得再次申请食品生产许可。第五十二条被许可人以欺骗、贿赂等不正当手段取得食品生产许可的，由原发证的食品药品监督管理部门撤销许可，并处1万元以上3万元以下罚款。被许可人在3年内不得再次申请食品生产许可。第五十五条被吊销生产许可证的食品生产者及其法定代表人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员自处罚决定作出之日起5年内不得申请食品生产经营许可，或者从事食品生产经营管理工作、担任食品生产经营企业食品安全管理人员。
卫生许可证和食品卫生许可证的区别：《卫生许可证》适用于旅馆、美容美发店、浴池、网吧等公共场所，归卫生部门管理。《食品卫生许可证》现已经取消，取代它的是《流通许可证》，适用于食品的批发或零售，归工商部门管理。《食品经营许可管理办法》第二条，在中华人民共和国境内，从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。食品经营许可的申请、受理、审查、决定及其监督检查，适用本办法。
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