业务层面控制，是指综合运用各种控制手段和方法，针对具体业务和事项实施的控制。主要的控制项目包括如下：
(一)资金活动控制
资金是企业生存和发展的重要基础，被视为企业生产经营的血液。资金活动，是指资金流入与流出企业，以及资金在企业内部流转的总称，包括筹资、投资和资金营运等活动。
资金活动内部控制的总体要求：第一，科学决策是核心。第二，制度建设是基础。第三，业务流程是重点。第四，风险控制点是关键。第五，资金集中管理是方向。
资金活动控制应特别注意两个方面：
第一，财会部门负责资金活动的日常管理，参与投融资方案等可行性研究。总会计师或分管会计工作的负责人应当参与投融资决策过程。第二，企业应当采取合法有效措施，强化对子公司资金业务的统一监控。有条件的企业集团，应当探索财务公司、资金结算中心等资金集中管控模式。
1.资金活动中的主要风险
(1)筹资决策不当，引发资本结构不合理或无效融资，可能导致企业筹资成本过高或债务危机。
(2)投资决策失误，引发盲目扩张或丧失发展机遇，可能导致资金链断裂或资金使用效益低下。
(3)资金调度不合理、营运不畅，可能导致企业陷入财务困境或资金冗余。
(4)资金活动管控不严，可能导致资金被挪用、侵占、抽逃或遭受欺诈。
2.筹资活动中的关键控制点及控制措施
(2)论证筹资方案。不得依据未经论证的方案开展筹资活动。重大筹资方案应当形成可行性研究报告，全面反映风险评估情况，包括筹资方案的战略评估、经济性评估、风险评估。
(5)严格按照筹资方案确定的用途使用资金。因市场环境变化等确需改变资金用途的，应当履行相应的审批程序。严禁擅自改变资金用途。
(6)严格执行筹资合同约定的条款，加强债务偿还和股利支付环节的管理，对偿还本息和支付股利等作出适当安排。股利分配方案应当经过股东(大)会批准。
3.投资活动中的关键控制点及控制措施
(3)按照规定的权限和程序对投资项目进行决策审批。重大投资项目，应当按照规定的权限和程序实行集体决策或者联签制度。投资方案发生重大变更的，应当重新进行可行性研究并履行相应审批程序。
(6)加强投资收回和处置环节的控制，对投资收回、转让、核销等决策和审批程序作出明确规定。企业对于到期无法收回的投资，应当建立责任追究制度。
4.资金营运环节的关键控制点及控制措施
(1)加强资金营运的过程管理，做好资金在采购、生产、销售等各环节的综合平衡，全面提升资金营运效率。
(2)严格按照预算要求组织协调资金调度，确保资金及时收付，严禁资金体外循环。
(3)定期组织召开资金调度会或资金安全检查，对资金预算执行情况进行综合分析，避免资金冗余或资金链断裂。
(4)加强对营运资金的会计系统控制，严格规范资金的收支条件、程序和审批权限。
(二)采购业务控制
为实现采购与付款业务内部会计控制目标，建立以请购单、合同、验收单、入库单等结算凭证为载体的业务记录控制系统。凭证要连续编号、记录，签字盖章，做到账证、账账、账表、账实相符，并且检查有编号签字的凭证与记录是否按程序要求处理。
1.采购活动中的主要风险
(1)采购计划安排不合理，市场变化趋势预测不准确，造成库存短缺或积压，可能导致企业生产停滞或资源浪费。
(3)采购验收不规范，付款审核不严，可能导致采购物资、资金损失或信用受损。
【提示】采购业务不相容岗位至少包括：
①请购与审批。使用部门根据需要提出申请，分管采购工作的负责人进行审批。
⑤付款的审批与执行。企业付款的审批人与付款的执行人职务应当分离。
2.购买环节的关键控制点及控制措施
(2)按照预算执行进度办理请购手续。对于超预算和预算外采购项目，应先履行预算调整程序，由具备相应审批权限的部门或人员审批后，再行办理请购手续。
(3)建立科学的供应商评估和准入制度，确定合格供应商清单，与选定的供应商签订质量保证协议，建立供应商管理信息系统，对供应商提供物资或劳务的质量、价格、交货及时性、供货条件及其资信、经营状况等进行实时管理和综合评价，对供应商进行合理选择和调整。
(4)根据市场情况和采购计划，采取招标采购、询价或定向采购、直接购买等方式合理选择采购方式。
(5)合理确定采购价格。建立采购定价机制，采取协议采购、招标采购、谈判采购、询比价采购等多种方式。
(6)按照规定权限签订采购合同。根据确定的供应商、采购方式、采购价格等情况拟订采购合同，明确双方权利、义务和违约责任。
(7)建立严格的采购验收制度，确定检验方式，由专门的验收机构或验收人员对购买物资(劳务)进行验收，出具验收证明。发现异常情况，及时报告，及时处理。
(8)加强物资采购供应过程的管理，做好采购业务各环节的记录，确保采购业务的可追溯性。及时跟踪合同履行情况，对异常情况，出具书面报告并及时提出解决方案。
3.付款环节的关键控制点及控制措施
(2)加强预付账款和定金的管理，定期追踪核查大额或长期的预付款项，发现有疑问的及时采取措施。
(3)加强对采购活动的会计系统控制，详细记录供应商情况、请购申请、采购合同、采购通知、验收证明、入库凭证、商业票据、款项支付等情况，确保会计记录、采购记录与仓储记录核对一致。企业应当指定专人函证往来款项。
(4)建立退货管理制度，对退货条件、退货手续、货物出库、退货货款回收等作出明确规定，并在与供应商的合同中明确退货事宜，及时收回退货货款。
(三)资产管理控制
1.资产管理中的主要风险
(1)存货积压或短缺，可能导致流动资金占用过量、存货价值贬损或生产中断。
(2)固定资产更新改造不够、使用效能低下、维护不当、产能过剩，可能导致企业缺乏竞争力、资产价值贬损、安全事故频发或资源浪费。
(3)无形资产缺乏核心技术、权属不清、技术落后、存在重大技术安全隐患，可能导致企业法律纠纷、缺乏可持续发展能力。
2.存货管理环节的关键控制点及控制措施
(1)采用先进的存货管理技术和方法，规范存货验收程序和方法，对入库存货的质量、数量、技术规格等方面进行查验，验收无误方可入库。
(4)合理确定存货采购日期和数量，确保存货处于最佳库存状态。
(5)企业仓储部门应当详细记录存货入库、出库及库存情况，做到存货记录与实际库存相符，并定期与财会部门、存货管理部门进行核对。
3.固定资产管理环节的关键控制点及控制措施
(2)制定固定资产日常维修和大修理计划，定期对固定资产进行维护保养。
(3)强化对生产线等关键设备运转的监控，严格操作流程，实行岗前培训和岗位许可制度，确保安全运转。
(4)加大技改投入，不断促进固定资产技术升级，淘汰落后设备。
(5)规范固定资产抵押管理，确定固定资产抵押程序和审批权限等。
(6)建立固定资产清查制度，至少每年进行全面清查。
4.无形资产管理环节的关键控制点及控制措施
(1)分类管理。加强对品牌、商标、专利、专有技术、土地使用权等无形资产的管理，分类制定无形资产管理办法，落实无形资产管理责任制，促进无形资产有效利用。
(2)加强无形资产权益保护和保密措施，梳理外购、自行开发以及其他方式取得的各类无形资产的权属关系，防范侵权行为和法律风险。企业购入或者以支付土地出让金等方式取得的土地使用权，应当取得土地使用权有效证明文件。
(3)定期对专利、专有技术等无形资产的先进性进行评估，加大研发投入，促进技术更新换代，不断提升自主创新能力，努力做到核心技术处于同行业领先水平。
(4)加强品牌建设和声誉管理，提供高质量产品和优质服务以打造和培育主业品牌。
(四)销售业务控制
销售业务控制主要包括销售环节与收款环节。
1.销售活动中的主要风险
(1)销售政策和策略不当、市场变化预测不准确、销售渠道管理不当等，可能导致销售不畅、库存积压、经营难以为继。
(2)客户信用调查不到位，结算方式选择不当，账款回收不力等，可能导致销售款项不能收回或遭受欺诈。
(3)销售过程存在舞弊行为，可能导致企业利益受损。
2.销售环节的关键控制点及控制措施
(3)销售合同应当明确双方的权利和义务，审批人员应当对销售合同草案进行严格审核。建立健全销售合同协议审批制度，明确说明具体的审批程序及所涉及的部门人员，并根据企业的实际情况明确界定不同合同协议金额审批的具体权限分配等。审批人员应当对销售合同协议草案中提出的销售价格、信用政策、发货及收款方式等严格审查并建立客户信息档案。重要的销售合同，应当征询法律顾问或专家的意见。
(6)完善客户服务制度，加强客户服务和跟踪，不断改进产品质量和服务水平。
3.收款环节的关键控制点及控制措施
(1)完善应收款项管理制度。销售部门负责应收款项的催收，催收记录(包括往来函电)应妥善保存;财会部门负责办理资金结算并监督款项回收。企业应当及时办理销售收款业务，对以银行转账方式办理的销售收款，应当通过企业核定的账户进行结算。企业应当将销售收入及时入账，不得账外设账，不得擅自坐支现金，应当避免销售人员直接接触销售现款。
应收账款应分类管理，采取不同方法和程序。严格区分并明确收款责任，建立科学、合理的清收奖励制度以及责任追究和处罚制度，以有利于及时清理催收欠款。企业应当按客户设置应收账款台账。
(3)加强对销售、发货、收款业务的会计系统控制，详细记录销售客户、销售合同、销售通知、发运凭证、商业票据、款项收回等情况，确保会计记录、销售记录与仓储记录核对一致，并应当指定专人定期与客户核对往来款项。
(4)加强应收款项坏账的管理。应收款项全部或部分无法收回的，应当查明原因，明确责任，并严格履行审批程序，按照国家统一的会计准则制度进行处理。
企业核销的坏账应当进行备查登记，做到账销案存。已核销的坏账又收回时应当及时入账，防止形成账外资金。