很多自己有配方找工厂代加工合作的投资者，对于功能性食品和保健品什么区别并不是很清楚。其实，在国内对于功能食品并没有严格、准确的定义，而是泛指具有特定营养保健功能的食品，也就是带有小蓝帽标志的健字号保健食品。而按照常规理解，人们将含有药食同源物质的一些食字号产品也归类到了保健品。
产品涵盖类别范围不同：功能性食品指保健食品;保健品包括部分食字号产品、特殊膳食和健字号产品。我们这里已经把保健品限定在口服食品范围之内了，除此以外一些器械和外用产品，也会在保健品之列。
总体来讲，功能性食品和保健品两个名词，是人们对大健康产品的习惯性称谓，并不是严格意义上的产品类别分类。虽然指向不是特别准确，但是却能言简意赅的表明产品特点。
2，产品差异：功能性食品，也就是保健食品在备案号下来以后，便有了特定的配方、工艺、包装，这些数据都会体现在健字号批文中，并且产品实行一品一号，不可随意改动。食字号产品则不同，配方、剂型、包装都可在规定范围内，灵活设计。
4，工厂差异：食字号的压片糖果、固体饮料及代用茶产品，并不要求十万级的GMP车间，而被归为功能性食品的特膳膳食食品和保健食品则必须在十万级净化车间内。并且，从事保健食品代工生产厂家，需要具备产品批文中规定的完整生产工艺。
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