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一、规章制度与法律有冲突怎么办
第四条用人单位应当依法建立和完善规章制度，保障劳动者享有劳动权利和履行劳动义务。
第八十九条用人单位制定的劳动规章制度违反法律、法规规定的，由劳动行政部门给予警告，责令改正;对劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。
《中华人民共和国立法法》第九十五条地方性法规、规章之间不一致时，由有关机关依照下列规定的权限作出裁决:
(一)同一机关制定的新的一般规定与旧的特别规定不一致时，由制定机关裁决;
(二)地方性法规与部门规章之间对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用时，由国务院提出意见，国务院认为应当适用地方性法规的，应当决定在该地方适用地方性法规的规定;认为应当适用部门规章的，应当提请全国人民代表大会常务委员会裁决;
(三)部门规章之间、部门规章与地方政府规章之间对同一事项的规定不一致时，由国务院裁决。
二、如果法律条文有冲突怎么办
法律规范之间的冲突有四种类型：
(1)是不同位阶的法律规范之间的冲突。
(2)同一位阶法律规范之间的冲突。
(3)是不同时期发布的法律规范之间的冲突。
(4)是特别法与普通法之间的冲突。
行政审判中，对法律规范之间的冲突的处理，应当遵循以下原则进行：
第一，对于层级冲突应当确立高位阶的法律规范优于低位阶的法律规范的适用规则。
第二，对于新旧冲突，通常适用新的法律优于旧的法律规范的规则。
第三，对于特别冲突，通常适用特别法规范优于普通法规范的规则。
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