将一个人的DNA完全展开能有多长?竟可以在地球和太阳之间往返300多次。DNA作为人类的重要遗传物质,其完整性和保真性对人类行使正常的生物学功能至关重要。
然而,这无疑是一项艰巨的任务,因为DNA会不断受到遗传毒性因素(外源性和内源性)的破坏。作为一个成熟的DNA,它可以在大多数情况下启动自我修复程序。可一旦修复出现bug,就可能引起突变、细胞衰老或死亡,进而导致多种癌症和神经退行性疾病等的发生[1]。
因此,检测DNA损伤及修复,成为疾病机理研究、药物研发及筛选的重要环节。为此我们精心总结出目前常用的几种检测方法:
01实验室的浪漫:彗星实验(Cometassay)
彗星实验是一种可直接定量检测单细胞DNA损伤的灵敏技术。它是将细胞包埋于载玻片上的低熔点琼脂糖中,裂解细胞后进行电泳,受损的DNA比未受损的DNA更容易迁移。
通过显微镜观察得到的图像神似「彗星」,头部由完整的DNA组成,而尾部由单链(SS)或双链(DS)的受损DNA组成。彗星实验中常用的指标为尾长(taillength)、尾部DNA含量及尾矩(tailmoment),用于衡量DNA损伤的严重程度。
R&DSystems的CometAssay标准化系统提供检测的试剂盒、仪器、软件和辅助产品,以产生高度可重复、一致的实验结果。
为确定DNA的损伤类型,我们常常将使用DNA修复酶的片段长度分析法(FLARE,FragmentLengthAnalysisusingRepairEnzymes)与彗星实验联用,FLARE分析是在检测前即加入DNA修复酶以修复损伤的DNA,通过分析底物特异性来推断DNA损伤的类型。
02双链断裂标志物:γH2AX
组蛋白H2AX在核小体形成、染色质重塑和DNA修复中发挥着重要作用。一旦双链DNA断裂,它在Ser139位点发生磷酸化,成为γH2AX。γH2AX可标记双链断裂的位点,并募集细胞周期检查点和DNA修复因子至损伤位点。
由于γH2AX的水平在双链断裂后数分钟内升高,因而常被用作DNA损伤的标志物。定量检测γH2AX(R&DSystems,货号4418-096-K)表达水平可用于评估DNA损伤程度。
03单链断裂标志物:PAR及PARP
聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)可检测DNA中的单链断裂并启动DNA损伤修复反应。一旦检测到单链断裂,PARP就会与DNA结合并开始生成PAR链,作为其他DNA修复酶的信号。目前对于PARP抑制剂的研究正在不断开展,可作为多种疾病的潜在疗法,包括癌症、炎症、局部缺血和神经退行性疾病等[4-6]。
04氧化DNA损伤:8-oxo-dG与SOD
在损伤、感染和发炎后,许多组织中都会产生活性氧(ROS)和活性氮(RNS)。ROS和RNS引起的氧化损伤被认为是神经退行性疾病、组织损伤、癌症和衰老过程的关键因素。
8-羟基-2′脱氧鸟嘌呤(8-oxo-dG)是DNA氧化的主要产物,当DNA损伤剂诱导其形成后,通过碱基切除修复途径将其从DNA中清除,随后被转运到唾液、尿液和血浆中。因此,8-oxo-dG是氧化DNA损伤和氧化应激的常用标志物。
R&DSystems8-oxo-dGELISA(货号4380-192-K)检测试剂盒采用竞争法原理,可定量检测DNA、血浆、尿液和唾液等样本中8-oxo-dG含量。
超氧化物歧化酶(SOD)是一种金属酶,可将超氧自由基(O2-)催化为过氧化氢(H2O2)和分子氧(O2),为机体抵抗氧化损伤提供了重要的防御力。通过R&DSystemsSOD比色法检测试剂盒(货号7500-100-K)可定量检测哺乳动物细胞和组织提取物中的SOD。
总的来说,对于DNA损伤及修复的研究不仅可以揭开基因组有序运转的奥秘,还有助于继续研发可以拯救生命的治疗方法。选择合适的实验方法完成DNA的「体检」,也成为众多实验室的必备技能。Bio-Techne提供多种DNA损伤检测所需的试剂、仪器、软件,为科研加油助力,现在购买更享惊喜好礼!
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参考文献:
[1].NimratChatterjee,etal.MechanismsofDNAdamage,repairandmutagenesis.(2017)EnvironMolMutagen,58(5),235-263.
[2].Wilk,A.etal.ExtracellularNAD+enhancesPARP-dependentDNArepaircapacityindependentlyofCD73activity.(2020)Sci.Rep.10:651.
[3].Menon,R.etal.SenescenceofprimaryamnioticcellsviaoxidativeDNAdamage.(2013)PLoSOne8:e83416.
[4].ChristopherJLord,AlanAshworth.PARPinhibitors:Syntheticlethalityintheclinic.(2017)Sci.Mar17;355(6330):1152-1158
[5].Leeanne,M.etal.Poly(ADP-Ribose)PreventsPathologicalPhaseSeparationofTDP-43byPromotingLiquidDemixingandStressGranuleLocalization.(2018)MolCell.Sep6;71(5):703-717.e9.
[6].WeronikaWasyluk,AgnieszkaZwolak.Poly(ADP-Ribose)PreventsPathologicalPhaseSeparationofTDP-43byPromotingLiquidDemixingandStressGranuleLocalization.(2021)JInflammRes.May6;14:1827-1844.
[7].Su,C.etal.HypersensitivityofBRCA2deficientcellstorosemaryextractexplainedbyweakPARPinhibitoryactivity(2017)Sci.Rep.7:16704.
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