答：（1）提高土壤肥力。这是生物肥料的主要功效，例如各种自生、联合或共生的固氮生物肥料，可以固定空气中的氮素，增加土壤中的含氮量；多种分解磷钾矿物的微生物，如硅酸盐细菌能分解土壤中的钾长石、云母及磷矿石，使其中难溶的磷、钾有效化。
（2）制造和协助农作物吸收营养。有些菌肥如“5406”抗生菌肥施用后，由于微生物的活动，不仅能增加土壤有效养分，还能产生多种激素类物质和各种维生素，从而促进作物的生长；根瘤菌肥中的根瘤菌向豆科植物一生提供的氮素，占其一生需要量的30%～80%；VA菌根是一种土壤真菌，它可以与多种植物根共生[8u58药材网www.8u58.com]，其菌丝伸出根部很远，可以吸收更多的营养供各种植物利用，其中以对磷的吸收最为明显。
（3）增强植物的抗逆性。有些生物肥料的菌种接种后，由于在作物根部大量生长繁殖，成为作物根际的优势菌，它们可分泌抗真菌和细菌的抗生素，从而抑制多种病菌的生长。VA菌根的菌丝则由于在作物根部的大量生长，除了可以吸收有益于作物生长的营养元素外，还可以增加作物对水分的吸收，提高作物的抗旱能力。
微生物肥料的主要功效是调理土壤、恢复土壤生态平衡、促进植物根系的发育。只要我们能知道植物根系的重要性，就能知道微生物肥料的重要性。微生物菌肥内含的多种功能性微生物菌进入土壤后，有益菌在繁殖过程中，分泌大量氨基酸，有机酸和无机酸充分溶解土壤固定的磷、钾和微量元素，并快速分解有机质，使无效养分转化成有效的养分，被植物再吸收利用，有益微生物通过光和热能源把空气中的氮固定下来被植物吸收利用，提高肥效减少化
生物肥料是靠微生物的作用发挥增产作用，其有效性取决于优良菌种、优质菌剂和有效的施用方法。一、生物肥必须选用质量合格的，质量低劣、过期的不能使用，菌肥必须保存在低温、阴凉、通风、避光处，以免失效。二、为尽量减少微生物死亡，施用过程中应避免阳光直射，拌种时加水要适量，使种子完全吸附。拌种后要及时播种、覆土，且不可与农药、化肥混合使用。三、一般菌肥在酸性土壤中直接施用效果较差，要配合施用石灰、草木灰等，
生物有机肥含有功能菌和有机质，能改良土壤，促使被土壤固定的养分释放。生物菌肥只含有功能菌，通过功能菌来提高土壤固定肥料的利用。生物有机肥的有机质本身就是功能菌生活的环境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不适合某些土壤环境。
机肥料是农业生产中的重要肥源，其养分全面，肥效均衡持久，既能改善土壤结构、培肥改土，促进土壤养分的释放，又能供应、改善作物营养，具有化学肥料不可替代的优越性，对发展有机农业、绿色农业和无公害农业有重要意义。农耕时代，化肥还不被大家所熟悉，中国农业主要就是家禽粪便，土壤有机质丰富，但是NPK含量少，作物收成不大。改革开放后，中国引进化肥，作物收成大增，使得多年来一直被农户认可。但30年后，土壤种的有
生物肥料按微生物的种类划分为：根瘤菌、固氮菌、芽孢杆菌、光合细菌、纤维素分解菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌和真菌。其中以根瘤菌的研究最深入、应用最广泛。当前我国生产上使用的菌种主要为根瘤菌、固氮菌、解钾菌等，主要的生物肥料品种有根瘤菌肥料、固氮菌肥料、解磷菌肥料、硅酸盐细菌肥料等。
生物肥料也叫微生物肥料、菌肥、细菌肥料，是利用微生物对氮的固定、对土壤矿物质和有机质的分解，从而刺激作物根系生长，促进作物对土壤中各种养分的吸收。生物肥料能改良土壤，活化被土壤固定的营养元素，提高化肥利用率，为作物根际提供良好的生态环境，是绿色农业和有机农业的理想肥料。专用型复混肥料中添加的生物肥料有复合微生物肥料、磷细菌肥料、硅酸盐细菌肥料、生物有机肥料等。
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