许多人都觉得“微生物菌剂和菌肥不能和杀菌剂、杀虫剂混用”，但是在实际应用中，有许多微生物菌剂与一些化学药剂一块混用，不仅不会导致微生物菌失活，反而使效果大大增强了，而有的混合使用会导致效果变差甚至没效果！
那么到底微生物菌能不能与杀虫剂、杀菌剂混合使用？又能够与哪些杀虫剂、杀菌剂混合使用呢？
一、了解哪些微生物是有益的
土壤微生物是土壤中细菌、真菌、放线菌和藻类的总称。土壤中一般以细菌数量最多，占总数的70%-90%，有益的细菌有固氮菌、硝化细菌和腐生细菌，有害的则有反硝化细菌。放线菌也属于细菌（原核生物，但有与真菌类似的菌丝和孢子），放线菌能够分解动植物的残体，由蛋白质分解氨，使土壤中的有机质增加，提高土壤肥力，但对其他微生物生长有抑制作用（拮抗），由放线菌产生的抗菌素很多制作成农业杀菌剂。真菌类微生物就比较多了，植物上的很多病害都属于真菌类型，如土传病害（根腐病、猝倒病、立枯病、晚疫病、灰霉病等），而一般的有益微生物基本是类属于细菌类型的。
二、市场主流微生物菌剂是什么菌
微生物菌剂与菌肥在市场上主要有：
1、细菌类（各种芽孢杆菌、光合菌）。
2、真菌类（菌根真菌、木霉菌、淡紫紫孢菌）。
3、放线菌类（抗生素类）。
4、复合菌类（EM菌，以及添加多菌种的复合制剂，复合植物源的微生物杀菌剂）
三、微生物菌能不能和杀虫剂、杀菌剂混用？
并且制成制剂的微生物菌，必定添加了靶向助剂，用来引导指向靶标，只要靶向助剂不失效，微生物菌有繁殖代谢活性，那么效果就不会失效。
1、大多数微生物菌剂都可以与杀虫剂混合使用，如苏云金杆菌可以与绝大多数农药混合使用，但是不能与强酸强碱类的杀虫剂混用。
3、特定的微生物菌剂与菌肥和杀菌剂组合，可以在不影响功能菌效果的前提下混合使用，可以起到效果互补的作用。即可调理土壤，又可以解决各种病害问题。
4、如果不确定微生物菌剂和菌肥中复合微生物菌是真菌还是细菌，尽量不要与化学杀菌剂混用。
5、土壤熏蒸与土壤处理后，再施用微生物菌剂和菌肥，是目前比较成熟运用的方法。
6、微生物肥料可以单独施用，也可以与其他肥料混合施用。但微生物肥料应避免与未腐熟的农家肥混用。与未腐熟的有机肥混用，会因高温杀死微生物，影响肥效。同时也要注意避免与过酸过碱的肥料混合使用。
7、微生物菌剂与菌肥应避免与能杀死该菌种的农药以及杀菌剂混用。
8、微生物菌进行喷雾时，由于使用量少，为减少浪费，务必采用二次稀释法配置。并且要在早上10点前或下午4点后施药，避免阳光直射，杀死芽孢。尤其是4点后用药，夜间潮湿的环境更有利于芽孢萌发。
9、微生物菌也可以用来蘸根，比如给西红柿蘸根的目的只有一个，就是一次性防除地下害虫，防止茎基腐病，防治根腐病。蘸根的药物如果是选用恶霉灵原粉，每30斤水可以加入5g，如果是采用亮盾，每30斤水可以加入20ml，如果是采用普力克，每30斤水也是加入20ml。同时加入15g嘉美红利，再加入10g枯草芽孢杆菌原粉。
大家可能有一个疑问，恶霉灵和枯草芽孢杆菌能同时用吗？完全没有问题。恶霉灵只对真菌有效，而且属于内吸性，持效效期非常长，而枯草芽孢杆菌它是有益菌当中的细菌种类，和恶霉灵之间没有冲突，也没有拮抗性，然后再加入10ml高氯氟防治地下害虫。
10、在使用微生物菌哈茨木霉菌与枯草芽孢杆菌时，建议把二者搭配起来使用，但建议大家把哈茨木霉菌和枯草芽孢杆菌一前一后间隔2-3天使用，如果把二者一起使用，枯草芽孢杆菌分泌的枯草菌素等物质可能会对哈茨木霉菌的萌发生长产生一定的抑制作用。
11、在哈茨木霉菌与枯草芽孢杆菌的使用上：
二者可以广泛应用在各类土壤和作物上，也可以在作物的各个生长阶段使用，但以在播种前一周、苗床期、定植后一周、病害发生前一周、病病发生初期、根系生长发育不良时使用效果最好。最佳使用环境为土壤PH值5-7.5、温度15-28度、田间湿润且不能太干燥。
在使用方法上可以用来基施、冲施、蘸根、灌根、拌种、喷雾（温湿度适宜的大棚内使用）。
12、哈茨木霉菌与枯草芽孢杆菌不可在高温强光环境、田间干旱缺水以及温度过低的情况下使用，使用前如果土壤比较干旱，则应当先浇小水补湿后再使用，使用后一周内应当保持土壤始终湿润，普通瓜果蔬菜建议每隔2-3个月为土壤补充1次。
13、哈茨木霉菌与枯草芽孢杆菌应当尽量避免与高浓度肥料、杀菌剂、杀虫剂、除草剂等一起使用。但是，因为哈茨木霉菌是真菌，所以可以和部分防治细菌的杀菌剂一起使用；因为枯草芽孢杆菌是细菌，所以可以和部分防治真菌的杀菌剂一起使用。
14、把哈茨木霉菌、枯草芽孢杆菌与腐熟有机肥、矿源黄殖酸嘉美红利、嘉美海力宝等一起使用，可以加快有益菌在土壤中的繁殖速度、提高有益菌在土壤中的活性。