2008年，“功能农业”的原型概念由赵启国院士在中国科学院编制的《到2050年中国农业科技发展路线图》中首次提出。
赵启国院士总结并提出了农业发展的三个阶段：
√高产农业就是“吃饱肚子”，不让大家挨饿。长期以来一直是农业的重要任务，甚至是今后中国农业工作者的重要任务之一；
√功能农业是为了“吃得健康”，属于第三阶段。通过农产品的营养和功能化，成为维持和改善人类健康的重要载体。
什么是功能性农业
功能农业是指农产品的营养化和功能化。是通过生物营养强化或其他生物技术手段，使农产品具有保健功能。
简单来说，所生产的农产品能够定量满足不同年龄段、不同人群对钙、铁、锌、硒等有益于人体健康的微量营养素需求，从而促进生长发育，发展，增进人类健康。免疫、抗癌、抗衰老的目标。
功能性农产品和功能性食品的概念在世界不同国家有所不同，但普遍认为其应具备三个基本属性，
1、食物的基本属性，既有营养又安全；
2、修饰属性，即具有色、香、味，能使人产生食欲；
3、功能属性，即对机体生理机能有一定的良好调节作用。
功能属性是普通食品所不具备的特性，而功能农产品和功能食品则是这三种属性的完美体现和科学结合。
功能性农业的使命
功能农业的使命是让农产品进入功能时代。功能农业的核心要求是农产品中一种或几种对健康有益的成分基本定量，可以标准化。目前，从狭义上讲，功能农业的实践应侧重于矿产等更容易实现标准化和集约化的品类；从广义上讲，功能农业还可以包括功能明确的农产品生产。赵启国院士预测，到2020年，我国功能性农产品将达到80-100种，产值将达到1000亿元。
根据食用对象不同，可分为两大类
第一类是日常功能性食品，即日常保健食品。
根据各类健康消费群体（如婴幼儿、老人、学生等）的生理特点和营养需求而设计，以促进生长发育或保持活力和活力为目的，强调其成分能充分发挥身体的防御功能和调节昼夜节律的工程食品。
第二类是特殊功能食品，即特定保健食品。
它着眼于一些特殊消费群体（如糖尿病患者、癌症患者、心脏病患者、便秘患者和肥胖者等）的特殊身体状况，强调食品在预防疾病和促进康复方面的调节作用，因此以解决消费者面临的问题。“健康与医疗”问题。
从以上分类来看，功能性食品介于食品和药品之间。
功能性农业发展的市场前景
据9月1日消息，中国工程院院士、中国农业科学院副院长万建民在“产业前沿技术大讲堂”专题报告中指出，“目前，约有20亿人世界上正在遭受‘隐性饥饿’。我国‘隐性饥饿’人口已达3亿。”
隐性饥饿是指由于营养失衡或缺乏人体必需的某些维生素和矿物质，以及其他营养素摄入过多而引起的隐性营养需求的饥饿症状。
2015年我国粮食总产量突破6亿吨，数量上基本满足人民群众需求，但“质”问题仍未解决：微量元素长期缺乏和失衡导致大量中国人，尤其是偏远山区的贫困人口营养不良，从而导致各种慢性病。
为解决隐性饥饿，2004年，国际粮食政策研究所在全球范围内启动“国际生物营养强化工程”，并依托中国农科院开展中国生物营养强化工程。
项目启动以来，已培育出十余个品种/品系的营养强化作物，包括铁、锌、维生素原A、叶酸等多种微量元素，以及玉米、甘薯、小麦、水稻等作物.
以发展富硒农业为例
富硒大米、富硒葡萄、富硒瓜……越来越多的富硒产品开始出现在我们的生活中。
1公斤富硒大米20-39元，一个富硒鸡蛋2.5-4.5元，50克富硒菊花在上海卖150-200元……
基于我国缺硒现状和富硒农产品在很大程度上可以满足人们科学补硒改善健康的需求，我国富硒农业的市场前景十分广阔。
功能性食品是未来高端食品的发展方向。由于功能性农产品和功能性食品的作用已为世界各国所公认，有专家认为，21世纪将是功能性农产品和功能性食品的世纪。让我们拭目以待。