1.性质不同：不动产证是房产证和土地使用权证书的合二为一；
2.防辐射标签不同：房产证没有防辐射标签，不动产证有防辐射标签；
3.内容不同：
不动产证的外页除了中华人民共和国不动产权证外，在其右上角写有不动产登记抵押权、异地登记、查封登记等登记类型；不动产证内页规定了权利人、证件种类、证件号、共有情况、权利人类型、登记原因、使用期限、取得价格（以万元/平米为单位）。
4.发证机关不同：
房产证：发证机关是市（县）房地产管理局（房产管理局）或市（县）人民政府；
不动产权证：动产登记机构由县级以上人民政府依法确定的、统一负责不动产登记工作的部门。
5.版本不同：房产证书只有一个版本，而不动产证书有两个版本，单一版和集成版两个版本。单一版证书记载一个不动产单元上的不动产权利，而集成版证书记载同一权利人在同一登记辖区内享有的多个不动产单元上的不动产权利。
6.费用不同：房产证需要当时办理这些证书时，要按照土地面积、房产面积分别进行两次测绘、缴纳两次测绘费用，缴纳两份制证成本费。不动产证测绘只要一次就行，制证的成本费也就收一次。
房产证办理所需材料清单是身份证、房屋的外业测绘调查表及分层分户平面图原件、房屋购销合同原件及补充合同原件、完税凭证、户口簿或户籍证明复印件、已婚的需要婚姻证明复印件等。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国民法典》第二百一十条不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。
第二百一十一条当事人申请登记，应当根据不同登记事项提供权属证明和不动产界址、面积等必要材料。
房产证办理流程是：
1.房产证办理人到房管局填写申请书；
2.提交必要材料到房屋登记部门办理；
3.房管局对申请人提交的材料进行审核，符合条件的办理并发放房产证。