主要从事专业:作物分子育种与种质创新、植物生物技术与基因工程
近年来,先后主持或参与了包括国家自然科学基金、科技部科技支撑课题、国家863计划课题、教育部博士学科点专项科研基金、农业部转基因生物新品种培育重大专项课题和中国博士后科学基金等在内的多项国家与省部级科研课题。发表在国内外重要学术刊物如:TrendsinGenetics,ScientificReports,Functional&IntegrativeGenomics,Genomics,PlosOne等多篇SCI论文。第一作者Sci论文引用共超过100次。
教育背景:
1999年9月至2003年8月四川农业大学大学本科(林学)获农学学士学位
2003年9月至2006年8月南京林业大学(林木遗传育种)获得农学硕士学位
2006年9月至2009年7月南京林业大学(遗传学)获得理学博士学位
工作简历
2016.04至今,浙江理工大学,生命科学学院,助理研究员
2015.05-2016.04,浙江大学,助理研究员
2013.04-2015.05,美国,EastCarolinaUniversity,博士后
2012.02-2013.03,浙江大学,助理研究员系党总支副书记
2009.12-2012.02,浙江大学,博士后
主要研究工作
2009.09-2014.08973计划课题:棉花纤维品质功能基因组研究及优质高产新品种的分子改良参加
2010.07-2012.7中国博士后科学基金会:转哈茨木霉ech42和nag70基因提高棉花抗黄萎病研究主持
2010.07-2012.07十二五国家863计划课题子课:分子标记辅助培育棉花新品种主持
2010.09-2011.12浙江省科技项目:适合新疆机械化收获的专用棉新品种选育及其应用参加
2011.01-2011.12农业部转基因生物新品种培育重大专项课题:转基因特色专用棉花新品种培育参加
2011.01-2015.12863重大专项:强优势棉花杂种优势机理与高效制种技术研究参加
2013.01-2013.12农业部转基因生物新品种培育重大专项课题:转基因特色专用棉花新品种培育参加
2013.01-2017.12863计划课题:棉花种子油分形成控制基因的挖掘与功能验证参加
2014.01-2015.12农业部转基因生物新品种培育重大专项课题:转基因特色专用棉花新品种培育参加
2014.01-2017.12国家自然科学基金面上项目:棉花对土壤镉污染修复效应及镉胁迫下应答调控的分子基础主持
2014.1-2016.12高等学校博士学科点专项科研基金新教师类:耐镉陆地棉新种质在镉胁迫下应答调控的蛋白质组学研究主持
主要学术成绩及贡献
(一)使用复杂模型研究多位点多等位基因的连锁与连锁不平衡,利用动态性状基因定位的统计模型进行植物生长发育的遗传控制研究
上述成果发表在《TrendsinGenetics》和《StatisticalApplicationsinGeneticsandMolecularBiology》上。其中发表在《TrendsinGenetics》的关于“Mappinggenesforplantstructure,developmentandevolution:functionalmappingmeetsontology”的论文,被SCI引频18次,其中他人引用8次。很多引文被发表在植物研究领域影响力高的期刊如《PlantPhysiology》、《NewPhytologist》、《Evolution》、《BrefingsinBioinformatics》等上,这些研究为植物进化及动态性状的遗传学研究提供了一条有效的途径。
(二)研究石蒜花色遗传多样性模式,阐明了长筒石蒜花色的调控机理
上述结果发表在《PloSone》、《Genomics》和《Molecularecologyresources》等期刊上。其中于2011年发表在《PloSOne》上关于“NaturalvariationinpetalcolorinLycorislongitubarevealedbyanthocyanincomponents.”一文SCI引用频率15次,他引13次。石蒜属植物作为一种难得的切花材料用于商业性切花生产,前景相当广阔,该研究为通过分子育种等手段,研究长筒石蒜的起源和系统进化、品种分类、新花色育种以及新品种的鉴定和保护奠定理论基础,再辅之必要的保鲜和花期调控技术,可望使石蒜成为具有中国特色的切花种类,为综合利用长筒石蒜这一中国特有的花卉资源做出贡献。
(三)从转录后水平和翻译水平方面研究非生物胁迫对棉花生长发育的影响
研究了铅胁迫下microRNA及其靶基因对棉花生长发育的影响,二倍体棉花发育过程中干旱和盐碱化对microRNA及其靶基因表达的的调控,从全基因组角度解析MYB转录因子在雷蒙德氏棉的特征,以及miRNA介导的MYB基因在棉花纤维发育过程中的调节和功能。
上述成果发表在《Functional&IntegrativeGenomics》和《Chemosphere》上,为明确陆地棉耐性遗传机制以及抗重金属胁迫棉花新种质筛选提供理论依据,也为土壤重金属污染治理提供实用的技术和方法。
(四)从全基因组水平比较分析R2R3-MYB基因家族在不同棉种中的作用
在二倍体棉种D基因组雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii)和A基因组亚洲棉(Gossypiumarboreum)全基因组测序完成的基础上,对棉花R2R3-MYB基因家族在全基因组水平上进行了鉴定和综合比较分析,并探索其受干旱及盐胁迫过程中的应答反应。雷蒙德氏棉基因组中有205个R2R3-MYB基因,分散分布在雷蒙德氏棉13条染色体上,分为13个不同的功能亚家族;片段复制导致了雷蒙德氏棉R2R3-MYB基因数目的扩增,而且雷蒙德氏棉R2R3-MYB复制基因在进化过程中经历了不太强烈的纯化选择作用,基因功能的分化严重;绝大多数雷蒙德氏棉R2R3-MYB基因在棉花干旱及盐胁迫响应反应中起着重要作用。利用雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组数据,对两个棉种中R2R3-MYB基因家族在胁迫中的响应进行综合比较结果表明:大部分R2R3-MYB直系同源基因在不同组织以及干旱及盐诱导下的表达模式存在一定差异,说明R2R3-MYB直系同源基因在雷蒙德氏棉和亚洲棉中的表达已经开始分化,推测可能与雷蒙德氏棉和亚洲棉经过物种特异的进化后适应不同的生存环境有关。
上述成果发表在《ScientificReports》上,为深入研究棉属植物在干旱及盐胁迫下的响应机制、两个基因家族在棉属中的系统发育关系以及棉花种子品质遗传改良奠定了基础。
研究论文
1.HeQ,JonesDC,LiW,XieF,MaJ,SunR,etal.Genome-WideIdentificationofR2R3-MYBGenesandExpressionAnalysesDuringAbioticStressinGossypiumraimondii.Scientificreports.2016;6:22980.
2.DongY,LiC,ZhangY,HeQ,DaudMK,ChenJ,etal.GlutathioneS-TransferaseGeneFamilyinGossypiumraimondiiandG.arboreum:ComparativeGenomicStudyandtheirExpressionunderSaltStress.Frontiersinplantscience.2016;7:139.
3.SunR,HeQ,ZhangB,WangQ.SelectionandvalidationofreliablereferencegenesinGossypiumraimondii.Biotechnologyletters.2015;37(7):1483-93.
4.LiuW,LiW,HeQ,DaudMK,ChenJ,ZhuS.Characterizationof19GenesEncodingMembrane-BoundFattyAcidDesaturasesandtheirExpressionProfilesinGossypiumraimondiiUnderLowTemperature.PloSone.2015;10(4):e0123281.
5.DaudMK,HeQ,LeiM,AliB,ZhuSJ.Ultrastructural,metabolicandproteomicchangesinleavesofuplandcottoninresponsetocadmiumstress.Chemosphere.2015;120:309-20.
6.XieF,StewartCN,Jr.,TakiFA,HeQ,LiuH,ZhangB.High-throughputdeepsequencingshowsthatmicroRNAsplayimportantrolesinswitchgrassresponsestodroughtandsalinitystress.Plantbiotechnologyjournal.2014;12(3):354-66.
7.SunR,WangQ,MaJ,HeQ,ZhangB.DifferentiatedexpressionofmicroRNAsmayregulategenotype-dependenttraitsincotton.Gene.2014;547(2):233-8.
8.LiuW,LiW,HeQ,DaudMK,ChenJ,ZhuS.Genome-widesurveyandexpressionanalysisofcalcium-dependentproteinkinaseinGossypiumraimondii.PloSone.2014;9(6):e98189.
9.LiW,LiuW,WeiH,HeQ,ChenJ,ZhangB,etal.Species-specificexpansionandmolecularevolutionofthe3-hydroxy-3-methylglutarylcoenzymeAreductase(HMGR)genefamilyinplants.PloSone.2014;9(4):e94172.
10.HeQ,ZhuS,ZhangB.MicroRNA-targetgeneresponsestolead-inducedstressincotton(GossypiumhirsutumL.).Functional&integrativegenomics.2014;14(3):507-15.
11.LiuH,QuampahA,ChenJ,LiJ,HuangZ,HeQ,etal.QTLmappingbasedondifferentgeneticsystemsforessentialaminoacidcontentsincottonseedsindifferentenvironments.PloSone.2013;8(3):e57531.
12.HeQ,ShenY,WangM,HuangM,YangR,ZhuS,etal.NaturalvariationinpetalcolorinLycorislongitubarevealedbyanthocyanincomponents.PloSone.2011;6(8):e22098.
13.CuiSJ,HeQ,ChenY,HuangMR.EvaluationofsuitablereferencegenesforgeneexpressionstudiesinLycorislongituba.Journalofgenetics.2011;90(3):503-6.
14.HeQ,CuiSJ,GuJL,ZhangH,WangMX,ZhouY,etal.AnalysisoffloraltranscriptionfactorsfromLycorislongituba.Genomics.2010;96(2):119-27.
15.HeQ,BergA,LiY,VallejosCE,WuR.Mappinggenesforplantstructure,developmentandevolution:functionalmappingmeetsontology.Trendsingenetics:TIG.2010;26(1):39-46.
16.BergA,HeQ,ShenY,ChenY,HuangM,WuR.Trilocusdisequilibriumanalysisofmultiallelicmarkersinoutcrossingpopulations.Statisticalapplicationsingeneticsandmolecularbiology.2010;9:Article16.
17.HeQ,ShenY,ChenY,ZhouY,BergA,WuR,etal.Developmentof16polymorphicsimplesequencerepeatmarkersforLycorislongitubafromexpressedsequencetags.Molecularecologyresources.2009;9(1):278-80.
18.欧婷;何秋伶;陈进红;祝水金.基于抗草甘膦基因的棉花茎尖农杆菌介导转化方法的研究.棉花学报,2013(5)
19.王安可;何秋伶;潘晶晶;孙英超;祝水金;陈进红.农杆菌介导的VgDGAT1a基因棉花茎尖转化体系优化研究.浙江大学学报,2013(3)
20.何秋伶.长筒石蒜花色变异的分子基础.江苏省优秀博士论文(2010)
21.何秋伶;陈英;戴咏梅;杨春霞;黄敏仁.转GAFP-NPI基因香石竹.分子植物育种,2007(3)
22.陈英;何秋伶;诸葛强;黄敏仁;王明庥.林木基因工程研究进展.分子植物育种,2006(1)