在新生儿先天性畸形中，最常见的是神经管畸形。这是一类可以预防的疾病。研究表明，在早孕期缺乏叶酸，很容易发生神经管畸形。而神经管畸形是发生率最高的先天畸形。现在很多地方，对孕妇免费提供小剂量叶酸（0.8mg）。其实，最好在怀孕前三个月开始服用小剂量叶酸。由于胎儿各器官系统的分化、发育都在孕早期，有些地方推荐孕妇从孕前3个月开始，服用到孕3个月止。这对胎儿的发育，预防神经管畸形非常必要。但叶酸除了在神经管发育中起重要作用外，在红细胞的形成过程中也具有重要意义。由于胎儿的需要，对叶酸的需求随着孕期的增加而增加，所以国内外很多医生推荐孕妇服用叶酸直到哺乳期结束。
在孕早期（国内指从怀孕到妊娠12周止），胎儿“长身体”需要的物质“量”是很小的。由于胎盘激素的作用，即使孕妇体内某种营养物质处于较低水平，胎儿也会通过一系列复杂的生物学机制，从母体中获得。但一旦进入到孕中期（从妊娠13周起到妊娠27周止），即使胎儿像寄生虫一样从母体中索取营养，母亲也不一定能满足胎儿生长的需要。这时母亲就要有其他渠道补充。否则，母亲的健康和胎儿的发育都可能受到影响。
最常受到影响的矿物质是铁和钙。铁是合成红细胞的材料。胎儿在体内合成红细胞，其铁都来自妈妈的身体。如果妈妈不及时补充，母亲就会首先贫血。孕妇轻度贫血后，血液的粘滞度下降，胎儿从母亲体内获得营养物质的利用率上升，导致胎儿体重过重。这种过重无论对母亲还是孩子，都没有好处。而贫血中度、重度的母亲，由于长期慢性贫血，会产生贫血性心脏病，在孕期是非常危险的，严重时会危及母亲生命。
由于受“吃啥补啥”的影响，有些人认为贫血时就应该吃血液（动物血）来补充血液中的铁。这在一定程度上是对的，但从营养均衡的观点看，就不适宜了。有些人信中医，以为吃阿胶、红枣等红色的东西就可以“生血”“补血”，这是更大的误解。中医的“血”与现代医学中的血，是两个风马牛不相及的概念。
钙是合成骨骼的原料。如果缺钙，胎儿也会从母亲的体内获得。母亲骨头中的钙，会慢慢析出到血液中，导致母体发生缺钙。母亲一旦缺钙，神经肌肉的兴奋性会升高，表现为失眠和小腿肌肉痉挛，俗称“腿肚子抽筋”。如果孕妇到了这一步才去就诊，就有点晚。不过即使晚点就诊也比不就诊好。有些人一味地抵制药物，认为骨头汤里有钙，肉里有钙，除了海吃猛喝之外，实际上没有什么好处。其实，骨头汤里虽然有钙，但钙的吸收是个复杂的过程，一定要有维生素D的参与。如果体内没有维生素D，期望在食物中获得钙，是不可能的。体内缺乏维生素D时，钙会从肠道内流失，而不是吸收。其次，期望从食物中获得钙的同时，能量、脂肪等等也就超标了。最后危害的还是孩子。所以，从孕中期开始要及时补钙，一直到孩子断奶为止。除了这两大类矿物质外，孕期由于胎儿生长发育的需要，孕妇也很容易发生锌、镁、铜、磷、锰等矿物质的缺乏。
第三大类容易缺乏的是各种维生素如维生素A、维生素D、各种B族维生素等等。维生素是参与体内代谢的一类小分子物质，需要量虽小，但非常重要，有的还参与胎儿心脏的发育。我们中国人的饮食中生吃的菜肴很少，这点与洋人完全不同。洋人绝大部分菜肴是生吃，菜中的维生素丢失较少；国人喜欢炒熟了再吃。烹饪的过程容易破坏蔬菜中的维生素。所以，到了孕中期要及时补充各种维生素和矿物质。有人由于不了解生物学自身调节的机制，不了解维生素与矿物质之间的关系，比如以为单纯的补充维生素D就可以防治佝偻病。其实这是误解。单纯的补充维生素D而不及时补充钙，维D会使身体从骨骼里析出更多的钙，反而导致佝偻病的发生。
蔬菜、水果的营养看起来不高，其实蔬菜中含有纤维素，促进肠蠕动；当然蔬菜中也含有维生素、矿物质。所以不偏食、挑食的人，通过饮食可以获得足够的各类营养物质。如果为了补充体内某种物资去食补，会使人体内的能量失衡，产生超重等不利后果。因此，孕期的饮食用句简单的话说就是：均衡饮食辅之以多种复合维生素和矿物质。
有些麻烦的是如何服用DHA产品。DHA是一种特殊类型的脂肪酸，对胎儿的神经系统发育有重要意义。国内营养学界推荐给孕妇的摄入量是200mg/天。但在孕妇专用的多种复合维生素和矿物质产品中，不含DHA。DHA主要分布在鱼类中，普通饮食中的含量较少。所以孕期有意多吃些鱼虾，有利于补充饮食中DNA的不足。市场上一些保健品中的DHA，其含量有永高于200mg，似乎也不大适合于孕妇的补充。