1、泵头中有气泡。解决方法：将流动相用超声波清洗器进行脱气；打开排液阀，按PURGE功能键排除气泡；打开排液阀，用注射器从泵的排液管中抽液排除气泡。
2、单向阀堵塞，污染，磨损造成单向阀工作不正常。解决方法：LC-20AT是双泵头串联泵，在主泵头和辅泵头的下端分别装有入口单向阀，当送液泵出现压力波动超过0.3MP或者送液压力达不到正常压力值时，排除气泡干扰的因素后，初步判断单向阀被污染导致上述现象发生，可用下面两种方法清洗。第一种方法是在线清洗：打开仪器电源，确认键盘在开启状态，拆下泵的出口管，连接阻尼管，阻尼管的出口直接接入废液瓶，将流动相换成异丙醇，打开排液阀，按PURGE键更换流动相，等待其运行结束后关闭排液阀，按FUNC键将流速设为1mL/min，按PUMP键送液清洗，需要清洗一个小时以上。第二种方法是超声波清洗，操作如下：拧松并取下单向阀的管路用扳手分别松开两个泵头的入口单向阀，用手取下单向阀,用镊子将单向阀放入装有异丙醇的烧杯中，用超声波清洗15分钟，清洗完毕后将单向阀用镊子取出，装到泵头上，用扳手拧紧，将单向阀连接管路装好并拧紧，重新送液测试，如果压力正常则清洗完毕，如果故障依然存在，可能需要更换单向阀。
3、吸滤头堵塞。解决方法：吸滤头清洗或者更换。吸滤头是用于清除流动相中机械杂质的过滤器，在长期使用后，由于流动相中机械杂质的累积会导致吸滤头堵塞，堵塞后在送液时吸滤头不断有气泡出现进入送液管，清洗时将吸滤头从送液管中拔出，用镊子放入装有异丙醇的烧杯中，超声波清洗15分钟，清洗完毕后将吸滤头用镊子取出，用滤纸擦干后插入送液管，放入装有流动相的瓶中，送液测试，确认吸滤头没有气泡产生，否则应更换新的吸滤头。
二、泵压力偏高：按照以下顺序依次判断、处理。
1、泵的管路过滤器堵塞。断开泵的出口管路，以1mL/min送液压力高于0.3MP，说明管路过滤器堵塞。管路过滤器位于泵的出口处，用于清除由泵输送的流动相试剂中的机械杂质或柱塞密封垫磨损的碎屑。长期使用或使用含机械杂质较多的流动相时容易引起堵塞，此时需要清洗或更换过滤器上的过滤片，操作如下：拧松并取下过滤器连接管路，拧松并取下管路过滤器，用镊子将管路过滤器放入装有异丙醇的烧杯中，用超声波清洗15分钟，清洗完毕后用镊子取出过滤器，用手将过滤器拧入连接口，用手拧紧，用扳手拧紧60°～90°即可，打开泵电源开关，用纯水做流动相，以1mL/min送液，如压力值超过0.3MP，应更换新的管路过滤片。用镊子将过滤器前端的过滤片取下，把新的过滤片用纯水或异丙醇浸湿，放在过滤器座上，用手将过滤器拧入连接口，用手拧紧并用扳手拧紧60°～90°即可，连接上泵出口管路，更换完毕。
2、预混合室过滤片堵塞。断开混合室出口管路，以1mL/min送液压力高于1MP，说明预混合室过滤片堵塞。当混合室压力过高时，可能是由于混合室的过滤片污染所造成，解决方法操作如下：用扳手拧开预混合室的管路，用扳手取下预混合室，取出过滤片，取下的过滤片放在装有5﹪稀硝酸溶液的烧杯中，用超声波清洗15分钟，再用纯水清洗5分钟，将清洗后的滤片安装到预混合室中，拧紧预混合室，装好连接管路，清洗完毕。如果管路压力依然偏高需要更换过滤片。
3、进样器堵塞。断开进样器出口，以1mL/min送液压力高于1MP，说明进样器流路堵塞，建议使用清洗液洗进样器流路。
4、色谱柱堵塞或污染。断开色谱柱出口，送液压力仍高，说明色谱柱堵塞或污染，建议按色谱柱使用说明书清洗或者更换色谱柱。
三、泵压不稳：
2、单向阀堵塞，污染，磨损造成单向阀工作不正常。清洗单向阀或者更换。参见在线清洗或超声波清洗单向阀操作步骤。
3、吸滤头堵塞。超声波清洗吸滤头或更换。参见超声波清洗吸滤头操作步骤。
四、基线漂移：
2、管路污染。用清洗液清洗流路或更换被污染的部件。
3、流动相污染或纯度不够。流动相重新配置，净化处理或更换纯度高的流动相。
4、检测池污染。清洗检测池，参见检测池清洗操作步骤。
5、环境温度变化大。
6、泵压力不稳。参见泵压不稳故障诊断。
五、基线噪音大：
1、检测池有气泡。参见检测池清洗操作步骤。
2、流动相纯度不够，或流动相在使用波长下吸收大。更换纯度高的流动相或更换流动相种类。
3、检测池能量低。更换光源或光路部件。
4、仪器接地不良。重新连接地线，确定接地。
六、峰面积重现性差：
1、手动进样器污染。手动进样阀的清洗：峰面积重现性差或出杂峰时，有可能进样阀受到污染，在日常清洗不能解决问题时，需分解进样阀进行清洗，如果出现漏夜现象，通常需要更换进样阀转子密封垫。首先用附带扳手拧下进样阀2号口和3号口连接管，再拧下5号口和6号口废液管，用附带内六角扳手拧松手柄的两个固定螺丝，取下进样阀，用附带的内六角扳手交替拧松进样阀后盖的三个固定螺丝，取下固定螺丝，取下进样阀后盖，取出转子密封垫和定子，放入烧杯中，分别用水和异丙醇超声清洗10分钟，清洗完毕后将定子和转子密封垫取出，放到干净的滤纸上，查看转子密封垫的表面是否有划痕，如有划痕需更换，将转子密封垫晾干后，装入进样阀，注意安装的正反面，导针孔要对应好，将定子装入后盖中，再将后盖装到进样阀上，注意定位销要对准，将三个固定螺丝放到进样阀后盖螺孔中，用扳手交替并均匀拧紧，将进样阀装回拧紧固定螺丝，将5号口和6号口废液管连接好，将2号口和3号口连接管恢复，装上进样阀手柄，拧紧固定螺丝，进样阀清洗完毕。
2、手动进样器的进样口漏液。更换转子密封垫。
3、自动进样器清洗液流路有气泡。选择合适的清洗液并脱气，使用PURGE功能冲洗进样阀，排除气泡。
5、自动进样器流路污染。使用清洗液清洗进样器管路。
1、泵压力不稳。参见泵的故障诊断。
2、环境温度变化大。
3、色谱柱未充分平衡好。充分平衡色谱柱。
4、梯度洗脱时流动相混合比例异常。确认各流路的流速是否正确。
八、峰形异常：
2、流路污染。使用清洗液清洗流路
3、流路死体积大。检查管路连接处，正确连接管路，消除死体积
九、常见错误信息：
1、泵的常见错误信息
⑴ERRORP-MAX
泵压超过设定的最大压力值，检查流路是否有堵塞现象或更改最大压力值
⑵ERRORP-MIN
泵压低于设定的最小压力值，检查流路是否有漏液现象或更改最小压力值
⑶OPENDRAINVALVE
PURGE时请打开排液阀旋钮
⑷ERRORLEAK
漏液报警，检查泵是否存在漏液现象。
2、自动进样器的常见错误信息
⑴NOVIALDETECTED
自动进样器未检测到样品瓶，确认样品瓶是否放入
⑵ERRLEAKDETECT
漏液报警，检查自动进样器是否存在漏液现象
⑶DOORISOPEN
自动进样器门没有关好，进样时请关好自动进样器的门
3、紫外检测器的常见错误信息
⑴ERROVENCURRENT
灯电流过载，建议更换氘灯
⑵ERRD2LAMP
氘灯错误，建议更换氘灯
⑶CHECKNOGOOD
波长自检未通过，清洗检测池，排出气泡，重新进行波长校准
⑷ERRLEAKDETECT
漏液报警，检查紫外检测器是否存在漏液现象
4、示差检测器的常见错误信息
⑴“ALARM”DISPLAY
总能量值偏低，清洗检测器的样品池和参比池或更换钨灯
⑵ERRORLEAK
漏液报警，检查示差检测器是否存在漏液现象
5、荧光检测器的常见错误信息
⑴ERROVERHEAT
过热报警，疏通检测器散热口，降低环境温度
6、柱温箱的常见错误信息
⑴ERRLEAKDETECT
漏液报警，检查柱温箱是否存在漏液现象
⑵WARNING：LOWSETTEMP
温度设定过低，请重新设置温度
十、使用缓冲溶液时的清洗：
如果使用缓冲溶液作为流动相，它蒸发时可能会在流路中生成结晶。柱塞和柱塞密封圈上的结晶可能会损坏柱塞或密封圈并缩短它们的使用寿命，所以，如果使用缓冲溶液，很重要的一点是经常使用蒸馏水清洗密封圈内表面和柱塞表面，以保护它们并延长其使用寿命。手动清洗的周期一般为：对于磷酸缓冲溶液（低浓度）一天几次。对于硼酸缓冲溶液（低浓度）一天数次。在使用缓冲溶液操作后不再继续使用仪器，请务必使用蒸馏水或去离子水替换流路中的缓冲溶液，以防止缓冲溶液结晶沉积。
十一、色谱柱的日常保养：
1、购买新柱后一定要仔细阅读说明书，确认柱的使用条件以及清洗再生步骤，按照说明书条件测试色谱柱柱效，记录使用压力
2、定期检测柱压和柱效
3、不同流动相之间转换时应注意溶剂的互溶性
4、确认样品不会在流动相中析出或带有固体不溶物，请使用0.45μm或0.22μm的一次性滤膜过滤样品，或者进行前处理
5、为了延长色谱柱使用寿命，请使用保护住
6、定期用合适的溶剂清洗或再生色谱柱
7、长期不用时，清洗干净后，使用柱子说明书中指明的溶剂保存，柱子要从仪器上卸下并用堵头密封后保存