农村合作社与普通的工业会计建账没有太大区别。账簿设置总账、明细账、银行日记账、现金日记账，建立固定资产卡片，根据需要可以设置存货账簿。唯一有区别的在科目上，需要加“林木资产”对经营、购买、培育的农产品进行核算。“林木资产”下应设置两个二级分类。分别为“经济林木”与”非经济林木”。
合作社建账的会计分录
一般情况下合作社成员以土地经营权入股(一般都是双方约定一个合作社使用年限，并按照经过批准的评估价值或双方确认的价值计价)。分录如下：
借：无形资产―土地使用权
贷：实收资本
生产经营过程账务处理
1、固定资产购建账务处理
机械、仓库、办公设备等都计入固定资产。
(1)固定资产的购入
例：合作社购入拖拉机一台价格4800，采用银行付款。
借：固定资产—手扶拖拉机4800
贷：银行存款4800
(2)自建固定资产
合作社，自建仓库，总支出费用28000元。
建设中的会计分录
借：在建工程—仓库房屋28000
贷：银行存款28000
库房建好后转为固定资产
借：固定资产—仓库房屋28000
贷：在建工程—仓库房屋28000
（3）收到捐赠的固定资产
合作社收到农机局捐赠一台12马力方向盘式拖拉机，价值45000。
借：固定资产—拖拉机45000
贷：营业外收入—接受捐赠45000
如果是政府的专项基金扶持，则：
贷：专项基金—接受捐赠45000
(4)购买林木资产账务处理
合作社购1年生苹果苗5元/棵，每亩种植60棵，总计种植31200棵，价值156000元(520亩×60棵×5元/棵)。
借：在建工程—林木资产—苹果树156000
贷：银行存款156000
注：苹果树苗木没产果前各类费用支出都应计入“在建工程—林木资产”科目，如各类浇地、施肥费用等;经济林木投产后发生的管护费用，不再记入“林木资产”科目，借记“经营支出”科目，贷记“应付工资”等科目。
林木投产(产果)前：
借：在建工程―林木资产―苹果树
贷：应付工资―应付工人工资
贷：存货―化肥、农药
林木投产后结转
借：林木资产——经济林木―苹果树
贷：在建工程―林木资产―苹果树
林木投产(产果)后费用分录：
借：经营支出—苹果树—化肥、农药
贷：库存物资―农药、化肥
借：经营支出—苹果树—工人工资
3、固定资产的折旧及林木资产的摊销
在会计处理上农业会计与一般的会计不同。一般会计只对固定资产折旧，农业会计除去固定资产外，还需要对经济林木折旧。经济林木：果、桑、茶树等5-15年(农业企业固定资产折旧年限详见《农业企业财务制度》附件中的农业企业固定资产分类折旧年限表)。
经济林木投产后，其成本扣除预计残值后的部分应在其正常生产周期内，按照直线法摊销，借记“经营支出”科目，贷记“经济林木”科目。分录如下：
借：经营支出—小麦—房屋折旧
贷：累计折旧—仓库房屋(房屋折旧20年)
借：经营支出—小麦—机械折旧
贷：累计折旧—拖拉机（机械折旧10年）
借：管理费用—房屋折旧
贷：累计折旧—房屋—办公用
借：经营支出—经济林木—苹果树
贷：林木资产—经济林木—苹果树
4、固定资产的清理账务处理
处置固定资产，其会计处理一般经过以下几个步骤：
第一，固定资产转入清理。固定资产转入清理时，按固定资产账面价值，借记“固定资产清理”科目，按已计提的累计折旧，借记“累计折旧”科目，贷记“固定资产”科目。
第三，收回清理固定资产出售价格的账务处理。按实际收到的出售价款，借记“银行存款”科目，贷记“固定资产清理”科目。
第四，清理净损益的处理。
分录案例如下：
清理出售以前购置的4.5万元拖拉机，已计提折旧5年。
借：固定资产清理22500(总值—已折旧价值)
累计折旧22500(年折旧4500元×5年)
贷：固定资产45000
如产生清理费用则需要计入固定资产情况，人工费用500元
借：固定资产清理500
贷：现金(应付工资)500
变现价值需要转出固定资产清理，例：卖掉拖拉机5000元。
借：现金5000
贷：固定资产清理5000
这时固定资产贷方有余额则名表面，清理资产后出现收入，需要转入营业外收入。如果固定资产清理科目借方有余额则证明亏损，需要结转为“营业外支出”。
借：营业外支出—处置非流动资产损失18000
贷：固定资产清理18000
5、存货的账务处理
农业的存货包含原材料、种子、化肥、农药、树苗等。委托加工的农产品或转卖转销的农副产品也属于存货范畴。
购买种子、化肥、农药。
借：存货—小麦种子
贷：现金
借：存货—化肥—尿素
贷：现金(银行存款）
借：存货—农药
贷：现金(银行存款)
6、生产过程各种费用的账务处理
(1)播种(存货结转至经营性支出，下同)
借：经营支出—小麦—小麦种子
贷：存货—小麦种子
(2)施肥、用药
借：经营支出—小麦—化肥
贷：存货—化肥—尿素
借：经营支出—小麦—农药
贷：存货—农药
借：经营支出—苹果—化肥
贷：存货—化肥
(3)付工人工资及管理人员工资
借：其他支出—小麦—工人工资—苹果—工人工资
贷：应付工资—工人工资
借：管理费用—干部工资
贷：应付工资—干部工资
(4)租赁机械等其他支出
借：经营支出—玉米（）—机耕费用
(5)浇地电费
借：经营支出—小麦—电费
—苹果—电费
贷：应付账款—电费
上缴时
借：应收账款—电费
贷：银行存款
(6)收到国家粮食直补
借：现金(银行存款)
贷：补助收入—粮食补助
7、收获产品入库及销售过程的账务处理
(1)收获小麦、苹果，价值由成本转入
借：产品物资—小麦
贷：生产成本—小麦
借：产品物资—苹果
贷：生产成本—苹果
(2)①出售小麦/苹果
贷：经营收入—小麦/苹果
同时结转成本
借：产品销售成本—小麦/苹果
贷：产品物资—小麦/苹果
②接上例，有剩余的苹果，发生的储存费等其他一些销售费用的账务处理
借：产品销售费用—苹果
贷：现金(银行存款、应付款)
期末“产品销售费用”科目结转到“本年盈余”科目。
年终账务处理
1、支出类结转（支出类结转至生产成本内）
借：生产成本—小麦
贷：经营支出—小麦—土地租金
—化肥、农药
—种子
—电费
—机械费用
—工人工资
—房屋折旧
—机械折旧
借：生产成本—苹果
贷：经营支出—苹果—化肥、农药
—土地租金
其他支出直接转本年盈余
借：本年盈余
贷：管理费用—管理人员工资
—办公费用
—交通费用
营业外支出—处置固定资产18000
产品销售成本—小麦
产品销售成本—苹果
2、收入类结转
借：经营收入—小麦
—苹果
其他收入
补助收入—小麦
贷：本年盈余
3、盈余结转
年终提5%公积金，剩余70%分配，剩余30%留在未分配里。
①年终，结转本年盈余时：
贷：盈余分配—未分配盈余
②提取90510.15元(1810203×5%)公积金时：
借：盈余分配—各项分配
贷：盈余公积
③用盈余公积转增股金时：
借：盈余公积
贷：股金—各成员
④按成员与本社交易额比例提取盈余返还时，分别计算出返还给每个成员的金额和合作社返还总额，例本合作社返还总额为1496449.5元[(1810203-90510.15)×70%]：
贷：应付盈余返还—各成员
⑤按成员账户记录的成员出资额和公积金份额等提取应分配的剩余盈余515907.85元[(1810203-90510.15)×30%]：
借：盈余分配—各项分配515907.85
贷：应付剩余盈余—各成员515907.85
⑥结转各项分配时：
借：盈余分配—未分配盈余1810203
贷：盈余分配—各项分配1810203
⑦用现金支付成员应付盈余返还1203785元和应付剩余盈余515907.85元时：
借：应付盈余返还—各成员1203785
应付剩余盈余—各成员515907.85
贷：库存现金1719692.85
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