食品经营许可证实施细则规定提交的资料包括：
(一)食品经营许可申请书;
(二)营业执照或法人登记证等主体资格证明(复印件，并提供原件核对)。申请单位食堂许可，应当提交开办者的法人登记证、社团登记证或营业执照等主体证明文件;
(三)法定代表人(负责人或业主)、食品安全管理员的身份证明(复印件);
(四)与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件;
(五)企业食品安全管理制度。
其他特殊情形需要提交的资料已经明确。
1.关于食品安全管理员证书的问题：
根据《食品安全法》的规定，从事食品生产经营活动，应当有专职或兼职食品安全管理员，因此所有的食品经营者都应当填报食品安全管理员。考虑到目前的实际情况，对规模较小、仅从事简单的食品销售或制售的食品经营者如食杂店和小餐饮，可以不用提交食品安全管理员培训证书。
在广东《广东省食品药品监督管理局关于餐饮服务食品安全管理员的管理办法》未修订或废止前，除小餐饮外的其他餐饮服务经营者和单位食堂应当继续按规定提供食品安全管理员培训证书。
2.房产用途证明的问题：按照商事登记制度改革精神和提交资料清单，没有此项要求，但为了避免发证后带来的投诉等问题，受理资料或现场核查时如果发现经营场所属于不宜从事餐饮服务活动的区域如江河海边或者非商业性质的住宅区内，可以启动听证程序。
依据：
《食品经营许可管理办法》：第二十条县级以上地方食品药品监督管理部门认为食品经营许可申请涉及公共利益的重大事项，需要听证的，应当向社会公告并举行听证。
第二十一条食品经营许可直接涉及申请人与他人之间重大利益关系的，县级以上地方食品药品监督管理部门在作出行政许可决定前，应当告知申请人、利害关系人享有要求听证的权利。
3.场所设备设施平面布局流程图：应当提交，与第四项要求“食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件”相对应。
4.食品安全设备设施清单：包括冷冻冷藏保鲜、清洗、消毒、保洁、三防等设备实施，可以提交清单上传。监管端可不录入。
5.从业人员名单和健康证明：许可时根据实际情况提交，尚未招收从业人员的食品经营者可不提交。监管端不需逐一录入从业人员名单，可以文件的形式上传或导入。
按照《食品安全法》第四十五条第二款，从事接触直接入口食品工作的食品生产经营管理员应当每年进行健康检查，取得健康证后，方可上岗工作。对于非接触直接入口食品的从业人员如预包装食品销售者、餐馆收银员、洗碗工、保安等，不需提交从业人员健康证明。原申办《保健食品企业经营卫生许可证》需要提交两个人的健康证和上岗证，现在不需要提交。
直接入口食品指可以直接食用的、无包装的食品。有完整密封包装的食品不属直接入口食品。
6.食品安全管理制度：非注册为企业性质的食品销售经营者和中小型餐馆、糕点店、饮品店、小餐饮可不提交。单位食堂需要提交食品安全管理制度。
7.药店经营婴幼儿配方奶粉提交材料：
按照国家总局《食品经营许可管理办法》《食品经营许可审查通则(试行)》，并未对药店经营婴幼儿配方乳粉提交资料提出特殊要求，所以之前有关文件规定的无违规经营假冒伪劣药品等商品被有关监管部门予以处罚的记录、具有提供食品安全消费专业指导的人员和能力证明及参照《药品经营质量管理规范》的要求建立健全各项管理制度等资料无须提交。
8.销售散装熟食、散装酒的材料提交特别规定：申请销售散装熟食制品、散装酒的，应提交与挂钩生产单位的合作协议(合同)，提交生产单位的《食品生产许可证》或《食品小作坊登记证》等有效的许可证明材料。
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