在主页的Help栏目下，点击Downloads进入下载页面，往下拉，找到需要下载的文件。有两种下载方式：一种是浏览器下载，另一种是命令行下载，这里介绍第二种。
运行以下curl命令，会返回一个json文件，该文件包含了要下载的文件的真实地址，再通过curl命令下载，得到的CosmicMutantExport.tsv.gz即是需要的Cosmic记录数据库。
至于为什么要下载这3个文件，请看Annovar官方网站的介绍：
先解压：
gunzip-cCosmicMutantExport.tsv.gz>CosmicMutantExport.tsvgunzip-cCosmicCodingMuts.normal.vcf.gz>CosmicCodingMuts.normal.vcfgunzip-cCosmicNonCodingVariants.normal.vcf.gz>CosmicNonCodingVariants.normal.vcf下载制作Annovar数据库的脚本：
#制作编码区Cosmic数据库perlprepare_annovar_user.pl--dbtypecosmicCosmicMutantExport.tsv-vcfCosmicCodingMuts.normal.vcf>hg19_cosmic95_coding.txt#排序，因为上述命令得到的数据库是无序的，按染色编号进行排序sort-k1,1V-k2,2n-k3,3nhg19_cosmic95_coding.txt>hg19_cosmic95_coding_sort.txt#用排序后的数据库替换未排序的，hg19_cosmic95_coding.txt即为最终的编码区的Cosmic数据库，可供Annovar程序使用mvhg19_cosmic95_coding_sort.txthg19_cosmic95_coding.txt#制作非编码区的Cosmic数据库，跟编码区的一样perlprepare_annovar_user.pl--dbtypecosmicCosmicMutantExport.tsv-vcfCosmicNonCodingVariants.normal.vcf>hg19_cosmic95_noncoding.txtsort-k1,1V-k2,2n-k3,3nhg19_cosmic95_noncoding.txt>hg19_cosmic95_noncoding_sort.txtmvhg19_cosmic95_noncoding_sort.txthg19_cosmic95_noncoding.txt制作数据库索引通常，Annovar的数据库如果比较大，需要先建立索引文件后再使用，但是对于cosmic数据库，官网有一句：
Userscannotindexthefile,butthefilesizeisnottoolarge,andyoudonotneedtouseindexingtouseANNOVAR.
就是，库不算大，不建索引也挻快，那就干脆省略这一步。
运行以下命令测试：
ID=COSV58736910;OCCURENCE=2(thyroid)ID=COSV100633201;OCCURENCE=1(skin)ID=COSV58736947;OCCURENCE=1(large_intestine)ID=COSV100633198;OCCURENCE=1(stomach)ID=COSV58736924;OCCURENCE=1(thyroid)ID=COSV58737059;OCCURENCE=2(skin)