关于增值税进项抵扣，最近一直有几个问题困扰着大家：
1%的专票可以抵扣9%进项吗？
收到哪种农产品发票，可以计算抵扣进项？
农产品数电票怎么勾选抵扣？
明确！3%可以抵扣9%/10%，1%不能！
2020年的时候某省税局回复1%抵9%是可以的，但是在2021年的时候国家税务总局统一回复时表示：
划重点！取得“依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的”，所以取得1%农产品专票，不能按9%计算抵扣进项税额。在小规模新政策发布后，小规模3%减按1%优惠，取得1%农产品专票能不能按9%计算抵扣进项税额这个话题被再次提起，再次确认一下：
划重点：1、取得1%农产品专票不能按9%计算抵扣进项税额！不能！2、一般纳税人取得3%农产品专用发票，可以按照9%/10%计算扣除！另一官方回复参考：
当然，各地税务机关执行口径可能存在差别，具体建议还是咨询一下当地税务机关。
收到哪种农产品发票可以计算抵扣进项？
增值税一般纳税人购进农产品，可凭增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票或销售发票抵扣进项税额。具体哪些发票可以抵扣，怎么抵？是直接按照发票税额抵扣还是计算抵扣？
1、凭票扣除
2、核定扣除
试点纳税人以购进农产品为原料生产货物的，农产品增值税进项税额可按照以下方法核定：（1）投入产出法（2）成本法（3）参照法；核定扣除的基本处理思路是：采购环节将税额计入存货成本，待实际耗用或者对外销售时，再根据核定的允许抵扣的进项税额（含加计扣除增值税进项税额）借记“应交税费——应交增值税（进项税额）”科目贷记“主营业务成本”、“其他业务成本”等科目；注意：农产品收购发票或销售发票(1)农产品收购发票农产品收购发票是指收购单位向农业生产者个人（不包括从事农产品收购的个体经营者）收购自产免税农业产品，由收购方向农业生产者开具的发票。发票左上角会打上“收购”两个字。
如何申报抵扣？
(2)农产品销售发票农产品销售发票是指农业生产者销售自产农产品适用免征增值税政策而开具的普通发票。
纳税人在开具时税率应当选择“免税”，而不是“0%”，虽然免税和零税率都不征增值税，但两者的意义不同，纳税人要注意两者的区别。
农产品数电票如何勾选抵扣？
电子发票服务平台农产品抵扣操作
需要注意的是，农产品发票分为需要待处理的农产品发票与无需处理即可进行抵扣勾选的农产品发票。01、待处理的农产品发票1、自产农产品销售发票（用税控系统开具的普票）进入【待处理农产品发票】-【自产农产品发票】模块功能处理后再进行勾选，如下图所示。
录入“开票日期起”、“开票日期止”、“是否处理”三个必录查询条件后，点击【查询】按钮，根据实际情况进行选择“类型”，如下图所示。点击【提交】按钮，完成操作。
2、从小规模纳税人处购进的3%农产品专票
注意：如果是全电开具的自产农产品销售发票，则该发票直接在【抵扣类勾选】的【抵扣勾选】模块勾选，无需纳税人处理。进入【待处理农产品发票】-【从小规模处购进的3%农产品专票】模块功能处理后，再到【抵扣勾选】模块对发票进行勾选。点击【待处理农产品发票】-【从小规模处购进的3%农产品专票】会提示何种情况下可以使用该功能，如下图所示。
关闭提示信息，录入“开票日期起”、“开票日期止”、“是否处理”三个必录查询条件后，点击【查询】按钮，根据实际情况进行选择“类型”，如下图所示。
点击【提交】按钮，完成操作，提示信息如下图所示。
经过上述操作，这些发票就可以进入【抵扣勾选】-【发票】模块进行勾选啦。02、无需处理的农产品发票农产品收购发票、从一般纳税人处取得的9%农产品专用发票。点击【抵扣勾选】-【发票】进入。录入“开票日期起”、“开票日期止”、“是否处理”三个必录查询条件后，点击【查询】按钮，根据实际情况进行选择“类型”，如下图所示。点击【提交】按钮，完成操作。
注意特殊情形：税务机关代开开具的农产品发票需先到【抵扣勾选】-【代开农产品发票录入】（如下图）进行补录后，再进行勾选，如下图所示。
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