农村合作医疗的报销范围涵盖了门诊、住院和大病医疗等多个方面，旨在全面保障农民的健康需求。
门诊报销：
村卫生室及村中心卫生室就诊可报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
中药发票附上处方每贴限额1元，镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
住院报销：
药费、辅助检查费（如心脑电图、X光透视、拍片等）以及手术费均可按规定报销，其中检查费限额200元，手术费超过1000元的按1000元报销。
60周岁以上老人在指定卫生院住院，治疗费和护理费每天可补偿10元，限额200元。
大病医疗：
镇级合作医疗住院及特定大病门诊（如尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗）补偿年限额1.1万元。
新型农村合作医疗基金还报销支付特殊病种，如恶性肿瘤化疗、放疗，重症尿毒症的血透和腹透等，具体以当地政策为准。
二、住院医药费结报程序及时限
为确保农民能够及时获得医疗费用补偿，农村合作医疗设定了明确的结报程序及时限。
三、住院医药费补偿标准
农村合作医疗还设定了合理的补偿标准，以确保农民能够获得足够的医疗费用补偿。
起付线：市外医院600元，市区二甲医院400元，市内其它定点医院100元。每次住院符合补偿范围的医药费用不超过起付线的不予补偿。
补偿比例：起付线以上的医疗费用，二甲医院按75%补偿，定点医院按90%补偿。经转院到市外定点医疗机构就诊的按市区二甲医院补偿比例的80%补偿，未经转院到市外医院就诊的按区二甲医院补偿比例的70%补偿。每人每年累计补偿最高限额200000元。