李某是成都市某区村民，近两年利用空置的住房改建鸡舍，接受甲公司的委托，采用“公司+农户”的形式，为甲公司饲养肉鸡。合作方式是：甲公司提供鸡苗、饲料、兽药，李某负责饲养，肉鸡长成后，由甲公司收回，甲公司按照3元/只的价格支付代养费用。今年，甲公司要求李某扩大养殖规模，于是李某在村里租了一块地，修建了养鸡场，聘请村民20人帮工。上月出笼肉鸡10万只，李某可以收30万元代养费，但甲公司要求李某出具发票后，方能支付代养费用。李某没有办理税务登记证，没有领购发票，只好到税务机关代开发票。税务机关按照服务业征收5.55%的营业税金及附加，另外按收入额的3%核定征收个人所得税后代开了发票。李某缴税后一算账，饲养这批肉鸡，支付了工人工资20万元，水电费3万元，支付场地租金及养鸡场折旧摊销共计5万元，缴纳税款30×（5.55%+3%）=2.565万元。结果辛苦几个月，反倒亏损0.565万元，还不如前两年的收入（前两年因为收入没有达到起征点，未缴税）。
3.李某该缴多少个人所得税？如上所述，李某未建账，按照收入总额的3%核定征收，缴纳个人所得税0.9万元。如果李某建账，当月亏损，不缴纳个人所得税。这样就出现了问题，规模小而盈利，不缴税；规模大了亏损，因未建账还要缴税。
二、从公司的角度分析：1.“公司+农户”还是“公司+个体工商户”？在李某兴建养殖场以前，甲公司与李某签订委托养殖合同，无疑是“公司+农户”的经营模式。在李某兴建养殖场，注册成为个体工商户后，就成了“公司+个体工商户”。
建议——国家制定税收优惠政策，目的在于鼓励纳税人从事某行业的生产经营行为，要发挥优惠政策作用，税收优惠政策应该是一个全面系统的工程，不仅要考虑企业所得税的优惠，还要考虑增值税、营业税、个人所得税的优惠，实现优惠政策的协调配合；不仅要考虑这个行业某个环节的优惠政策，还要考虑这个行业整个产业链的优惠政策；不仅要考虑对该行业个别组织形式（例如“农户”）的优惠，还要考虑对其他组织形式（例如“农村专业合作社”、“个体工商户”、“个人独资企业”、“公司”、“合营企业”等等）的优惠。这样全方位配套的灵活的优惠政策，才能更好地鼓励纳税人，促进该行业的发展。因此，“公司+农户”经营模式的税收政策亟待完善。