（一）以大型连锁超市为主导的农产品供应链模式
我国现阶段以大型连锁超市为主导的供应链模式是我国农产品供应链的重要组成部分。大型超市主要从生产基地、批发商、农民合作组织、批发市场等渠道采购农产品。虽然采购方式多样，但是不利于管理，今后从生产基地、农民合作组织、大型农户直接采购将会是发展趋势。
一些大型连锁超市具有集聚效应，它们促进了农产品流通，便利了居民消费，有利于溯源系统的建设。但是大型连锁超市的辐射范围有限、超市准入门槛高、市区配送难等问题仍然突出。这需要更多的研究和探索，来补上这一短板。
（二）以批发市场为主导的农产品供应链模式
农产品批发市场是以粮油、畜禽肉、蛋类、水产、果蔬、茶叶、花卉、棉花、橡胶等农产品及其加工品为交易对象，提供买卖双方长期、固定场地设备设施，并具有形成价格、信息展示、商品集散等功能的场所。
农产品批发市场产地市场是建在靠近农产品产地的、以一种或多种农产品为交易对象的批发市场。销地市场是建在城市近郊甚至市区、以多种农产品为交易对象的批发市场。我国的农产品的70%以上经由该模式进入老百姓的餐桌，是连接产销双方的纽带，具有无可比拟的作用，未来，农产品批发市场仍然是农产品流通的主要渠道。
（三）以农民专业合作社为主导的农产品供应链模式
农民专业合作社由农民自发组成，代表农户的利益。当合作社位于上游时，它能为农户提供化肥种子等；中游则可以对生产活动及行为进行指导和质量监控；下游时，可以收购农产品。由于合作社是农户集体代表，有利于为生产者争取最大利益。
（四）以生产加工企业为主导的农产品供应链模式
该模式可以表示为：农户+（批发商）+加工企业+（批发商）+（零售商）。农产品不直接进入市场流通，而是进一步加工，提升产品附加价值后以更高价格进入市场。但是，在这种模式下，一是生产加工企业对农产品的种类、品质有着特殊的要求，相当大一部分产品无法达到标准。二是经过深加工的农产品虽然具有更高的价值但是市场容量却小得多，难以消化产量巨大的初级农产品。