苦瓜的主要病害有猝倒病、白粉病、炭疽病、枯萎病、蔓枯病、褐斑病、细菌性角斑病、霜霉病、疫病、病毒病等。其防治方法要在合理轮作的基础上，加强田间管理。如：在采收期间注意做好田园清洁，彻底清除遗留在田间的枯枝败叶，病株残体，同时，注意合理施肥和灌排水，在发病初期及时喷药，以防病害的扩展，具体防治方法如下：
一、猝倒病
1、主要症状
此病为真菌性病害，猝倒病在幼苗出土不久最易发生。初时幼苗幼茎基部呈水浸状，而后病部变淡褐色，幼苗近地面处明显缢缩，子叶尚未凋萎而倒伏。土壤温度低，湿度大时有利病菌的生长与繁殖，所以一般夜晚凉爽、白天光照不足、苗床湿度大时发病严重。
2、防治方法
①苗床消毒：种植前用70%五氯硝基苯与50%福美双于植沟中进行土壤消毒处理。②药剂防治：可用72.2%霜霉威盐酸盐750倍或用灵·代森或58%甲霜灵·代森锰锌或75%百菌清600倍或32%甲霜·恶霉灵300倍液喷于幼苗基部。
二、白粉病
此病为真菌性病害，苗期至收获期均可染病，以叶片发病较重，果实则很少发病受害。发病初期叶面或叶背上产生白色近圆形星状小粉斑，以叶面居多，后向四周扩展成边缘不明显的连片白粉，严重时整叶布满白粉。病害由植株下部老叶往上发展，发病后期，白粉变为灰色，病叶枯黄，但一般不脱落。温度和湿度是影响发病的重要条件，温度在16-24℃和湿度较大的条件下，病害易于流行、发病也重。高温干旱的气候环境病害发生较轻。
药剂防治：可喷①15%三唑酮（粉锈宁）乳油1500倍液；②12%腈菌唑可湿性粉剂2000倍液；③50%硫磺悬浮剂250倍液；④翠泽悬浮剂800倍液。其技术要点是早预防，并做到叶面叶背均匀喷药，严重时须联合2-3种药剂，隔5-7天1次，连喷2-3次。
三、炭疽病
此病为真菌性病害，种子及土壤中的病残体可带菌，并通过雨水，昆虫及人畜活动而传播，气温24℃左右，湿度在95%以上时，最易发生流行。在地势低洼、排水不良、瓜类连作地、种植密度过大、偏施氮肥或后期缺肥的情况下，病害往往较严重，此病多发生在植株生长的中后期，茎、叶、果均会发病，病斑呈圆形或椭圆形，外围有一圈明显或不甚明显的黄色环。
防治此病时，除用人工及时摘除残叶、烂叶外，还要加强水肥管理，蹲苗后进入枝叶及果实旺盛生长期，合理施肥，及时追施有机活化营养、高钾高钙套餐肥嘉美红利、赢利来、海洋之星等套餐营养增强植株抗病抗逆能力。雨季控制浇水量，注意通风透光，防止田间或棚室湿度过高。并及时中耕、培土，以促进根系生长。可用①70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液；②50%施保功可湿性粉剂2000-2500倍液；③25%凯润1500倍液，④10%世高水分散粒剂1500倍液,在发病初期每隔5-7天喷洒1次，连续防治2-3次。
四、枯萎病
枯萎病是瓜类作物毁灭性病害之一。整个生长期都能发病，但以开花结果后发病最盛。被害株最初表现为部分叶片或植株的一侧叶片，中午萎蔫下垂，似缺水状，但萎蔫叶早晚恢复，后萎蔫叶片不断增多，逐渐遍及全株，致使整株枯死。切开病茎观察，可见维管束呈黄褐色。
防治枯萎病关键是要实行轮作，药剂防治可用①4%五氯硝基苯或络氨铜500倍液；②70%恶霉灵600倍液；③50%多菌灵800倍液；④55%敌克松500倍液等喷雾,重者在植株根边浇淋，每株用药液250毫升，每隔7-10天再灌一次，连续防治2-3次。
五、蔓枯病
主要为害叶片、茎和果实，以茎受害最重。叶片染病，初期呈现褐色圆形病斑，中间多为灰褐色，后期病部生出黑色小粒点。茎蔓染病,病斑初为椭圆形或菱形，扩展后为不规则形，灰褐色，边缘褐色，湿度大或病情严重的常溢出胶质物，引起蔓枯，致全株枯死。病部也生黑色小粒点，即病原菌的分生孢子器或假囊壳。果实染病，初生水渍状小圆点，逐渐变为黄褐色凹陷斑，病部亦生小黑粒点，后期病瓜组织易变糟破碎。别于苦瓜炭疽病。
①选用抗病品种。②嫁接预防。即用苦瓜作接穗，丝瓜作砧木，把苦瓜嫁接在丝瓜上，播种前种子先消毒，再把苦瓜、丝瓜种子播在育苗钵里，待丝瓜长出3片真叶时，将切去根部的苦瓜苗或苦瓜嫩梢作接穗嫁接在丝瓜砧木上，采用舌接法把苦瓜苗切断接人丝瓜切口处，待愈合后再剪断丝瓜枝蔓，待苦瓜长出4片真叶时，再定植。③种子消毒。选用无病种子，必要时对种子进行消毒。④加强管理。施用充分腐熟的农家肥，适时追施嘉美红利、赢利来、核动力等套餐营养，防止植株早衰。⑤药剂防治。发病初期开始喷洒50％甲基硫菌灵·硫磺悬浮剂800倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或50％苯菌灵可湿性粉剂1000倍液，或80％炭疽福美可湿性粉剂800倍液，或40％新星乳油7000倍液，隔10天左右l次，连续防治2-3次。也可涂抹上述杀菌剂50倍液。
六、褐斑病
主要危害叶片。初时在叶片上产生褐色圆形小斑点，后逐渐扩展为近圆形或不规则形，黄褐色，周围常有褪绿晕圈，环境条件适宜时，病斑迅速扩大连接成片，最终整叶干枯。
①选择地势较高、排水良好的地块种植。②及时搭棚、整枝和摘叶，改善田间通风透光条件。③基肥以农家肥为主，追肥要氮、磷、钾、钙结合，选用嘉美红利、赢利来、核动力、海力宝等有机无机套餐营养并喷施嘉美脑白金、金点等叶面营养。④适时灌水，雨后及时排除田间积水，注意控制田间湿度。⑤重病地要实行轮作。⑥药剂防治：于发病前用25%咪鲜胺1500倍喷施预防；发病时用10%苯醚甲环唑1500倍或32.5%嘧菌酯·苯醚甲环唑喷施。
七、细菌性角斑病
主要危害叶片、茎蔓和果实。发病叶片初呈黄褐色水浸状小病斑，多角形，中央黄白色至灰白色，易穿孔或破裂。茎病部呈水浸状浅黄褐色条斑，后期易纵裂，清晨或湿度大时分泌出白色至乳白色菌液。
①种子处理。播种前种子用56℃温水浸种至室温后再浸24小时，捞出晾干后置于30－32℃条件下催芽，芽长3毫米时播种。
②农业防治。选用无病的种子。采用高畦地膜覆盖栽培，不仅能降低田间湿度，还能减少病菌传播，减少发病。与瓜类作物实行2－3年轮作，密度适宜，雨后及时排水。
③药剂防治。棚室或露地在发病前开展预防性防治，常用农药有72％农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，56％靠山水分散微颗粒剂800倍液，47％加瑞农可湿性粉剂1000倍液和300碱式硫酸铜悬浮剂400倍液。
八、霜霉病
苦瓜霜霉病主要为害叶片。初叶面现浅黄色小斑，后扩大，病斑受叶脉限制呈多角形或不规则形，颜色由黄色逐渐变为黄褐色至褐色，严重时病斑融合为斑块。潮湿时病斑背面长出灰色至紫黑色霉（孢子囊）层，遇连续阴雨则病叶腐烂，如遇晴天则干枯易碎，一般从下往上发展，病重时则全株枯死。
①施足腐熟农家肥做底肥，生长前期适当控制浇水，结瓜时期适当多浇水，但要严禁大水漫灌。植株适当稀植，增强通风透光。
②发病初期喷洒70％乙膦·锰锌可湿性粉剂500倍液、或58％雷多米尔锰锌可湿性粉剂500-600倍液、64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、50％甲霜铜或甲霜铝铜600倍液、72％霜脲锰锌(克抗灵)可湿性粉剂或72％杜邦克露可湿性粉剂800倍液，病情严重时可喷700倍液大水量，或改用69％安克锰锌可湿性粉剂或水分散粒剂1000倍液或47％加瑞农可湿性粉剂800-1000倍液，苦瓜对铜剂敏感苗期慎用，生长期要严格控制用量和浓度，以防发生药害。
苦瓜霜霉病与白粉病混发时，为减少打药次数可选用72%霜脲锰锌可湿性粉剂1000倍液加20%三唑酮乳油2000倍液；霜霉病与炭疽病混发时，可选用72%霜脲锰锌可湿性粉剂1000倍液加50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液；霜霉病与细菌性角斑病混发时，可选用60%琥·乙膦铝(DTM)可湿性粉剂500倍液或50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液加40%三乙膦酸铝可湿性粉剂300倍液兼防两病。生产上对上述杀菌剂产生抗药性的地区，可改用69%安克锰锌可湿性粉剂或水分散粒剂1000倍液。采收前3天停止用药。
九、疫病
苦瓜疫病多在开花以前显症。叶片染病先失去光泽，后呈水烫状萎凋下垂。一般下部叶片先发病，后逐渐向上蔓延。发病初期上述症状早、晚尚能恢复，病情严重时则不能复原。仔细观察植株基部变为水渍状发软，湿度大时可见病部长出很薄的一层白霉，即病菌的孢囊梗和孢子囊。
①采用高畦栽培，可减少与病菌接触、提高地温可起到早熟避病作用，如能采用地膜覆盖，效果更好。②尽量使瓜坐在垅上或高畦的畦面上，浇水时水深不要超过茎基部或坐瓜部位。发现病株立即拔除，并撤生石灰消毒。
③加强水肥管理，施用充分腐熟的农家肥，及时追施有机活化营养、高钾高钙套餐肥嘉美红利、赢利来、海洋之星等套餐营养增强植株抗病抗逆能力。
④中心病株出现后及时喷洒72%霜脲锰锌可湿性粉剂600倍液或72%克露或72%克霜氰可湿性粉剂600倍液、18%甲霜胺·锰锌可湿性粉剂600倍液、70%乙膦·锰锌可湿性粉剂500倍液、每667m2喷对好的药液50升，隔10天左右1次，视病情防治2-3次。
十、病毒病
病株叶片上呈现黄绿相间的花叶，植株矮小，尤以顶部幼嫩茎叶症状明显。新叶不舒展，叶面皱缩，产生黄绿斑驳（俗称鸽子藤），后期黄斑变坏死斑。早期发病，瓜苗生长不良，节间短缩，从下部叶片往上黄枯。
①选用抗（耐）病品种。②进行种子消毒。③实行轮作（有条件的最好实行水旱轮作）。④生长期定期叶面喷施瓜菜用叶面肥,促进生长及壮苗抗病。⑤及时防治蚜虫、蓟马和白粉虱，防止传染。⑥发现病株及时拨除、烧毁，并喷施氯溴异氰脲酸1000倍预防。⑦药剂防治：发病初期及时进行药剂防治，可用2%宁南霉素300倍或马啉胍·乙酸铜1500-2000液喷施。
十一、常见虫害
1、瓜实蝇：幼虫孵化后钻入瓜内取食，受害瓜先局部变黄，而后全瓜腐烂变质，内有蛆虫蠕动，造成大量落瓜，即使不腐烂，瓜畸形下陷，品质下降。
防治方法：①最有效的方法是诱杀成虫，可将香蕉皮用敌百虫浸后悬挂在瓜棚下，也可用甘薯煮熟发酵加敌百虫和少许香精用容器盛装悬挂棚内，每亩放20个点，每点约放半两，可诱杀成虫。②清除烂瓜，深埋或焚烧。③虫害发生重时，采用纸袋套瓜保护，防止成虫刺瓜产卵。④采用药剂中午或傍晚喷杀成虫，可选用以下药剂：1.8%阿维菌素乳油2000-3000倍液，或40%毒死蜱1500-2000倍液，或2.5%敌杀死2000-3000倍液喷施，每隔3-5天喷一次，连喷2-3次。
2、红蜘蛛：主要危害叶片，刺吸汁液，使叶片失绿黄化，植株早衰，幼瓜不能膨大，造成间隔开花结瓜和幼瓜畸形，缩短采收期，降低产量和品质。
防治方法：在苦瓜生长发育期间，注意检查叶片，如果发现有粉红色针头大小的幼虫吸附在叶片上，要及时喷洒药剂防治，每周喷洒1次，连喷2-3次。有效药剂有：丁氟螨脂、联苯肼酯、乙螨唑、噻螨酮、螺螨酯、阿维菌素、克螨特等交替使用。
3、白粉虱、蚜虫、茶黄螨等：主要危害叶片，刺吸汁液，使植株早衰，影响开花坐瓜，并传播病毒。
防治方法：当发现叶片受到白粉虱、蚜虫、茶黄螨的危害时，要立即喷药防治，用药有600-800倍蓟虱净、蓟甲虱1+1、啶虫脒、1.3%(苦参碱)、噻虫嗪、烯啶虫胺、菊马乳油、氯氰锌乳油、灭扫利、功夫菊酯或天王星等。
4、凤蝶，毒蛾、金龟子等：主要咬食叶片，减少养分积累，影响开花结瓜，使幼瓜不能膨大，产量明显下降。
防治方法：①以菌治虫。用含活芽孢100亿/克的苏云金杆菌悬浮剂400倍液或含活孢子50亿-100亿/克的白僵菌可湿性粉剂喷雾。②以虫治虫。将寄生蜂寄生的越冬蛹，从枝杈上剪下来，放置室内，寄生蜂羽化后放回园子，使其继续寄生,控制凤蝶发生数量。③药剂防治低龄幼虫期，喷洒80%敌敌畏乳油1500倍液或90%晶体敌百虫1000倍液、20%氰戊菊酯乳油3000倍液、2%氟丙菊酯乳油2000倍液或40%辛硫磷乳油1200倍液等。