微生物肥料是生物活性肥料，施用方法比化肥、有机肥严格，有特定的施用要求，施用中应注意以几点：
2.微生物肥料应避免在高温干旱条件下使用。在高温干旱条件下，微生物生存和繁殖会受到影响，不能充分发挥其作用。要结合盖土浇水等措施，避免微生物肥料受阳光直射或因水分不足而难以发挥作用。施用时要注意温度、湿度的变化，
3.微生物肥料可以单独施用，也可以与其他肥料混合施用。但微生物肥料应避免与未腐熟的农家肥混用，避免因高温杀死微生物，影响肥效。同时也要注意避免与过酸过碱的肥料混合使用。
4.微生物肥料应避免与农药同时使用。化学农药都会不同程度地抑制微生物的生长和繁殖，甚至杀死微生物，不能用拌过杀虫剂、杀菌剂的工具装微生物肥料。
5.微生物肥料不宜久放，拆包后要及时施用，因为包装袋打开后，其他菌就可能侵入，使微生物菌群发生改变，影响其使用效果。
6.由于微生物肥料是由活的微生物起决定作用，所以必须在有效期内使用。
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