学校源自1902年创办的河南大学堂，先后经历了河南高等学堂、河南高等学校、河南公立农业专门学校、国立第五中山大学农科、河南大学农学院等办学阶段。1952年全国院系调整时重新独立建制，更名为河南农学院。1984年12月更名为河南农业大学。2009年9月成为农业部与地方省政府共建的第一所省属农业高校。
1913年，河南公立农业专门学校开始招生。招收预科生农林各一班，每班80人，共160人。1913年，招蚕科学生60名，1914年元月入学。农、林、蚕预科共3班，每班学生60名。
1938年6月，河南大学农学院畜牧系析出，并入陕西武功国立农林专科学校，组建国立西北农学院。
1942年3月，省立河南大学改为国立河南大学。
1957年2月，河南农学院迁校至郑州市。
1959年10月，偃师小麦学校并入河南农学院。
1960年，郑州农业机械化专科学校并入，组建河南农学院农业机械化分院。
1973年7月，粮油工业系调出河南农学院。组建恢复了郑州粮食学院。
1975年3月，河南农学院改名为许昌农学院。
1977年4月，学校恢复“河南农学院”校名，并逐渐返回郑州办学。
1984年12月，学校更名为“河南农业大学”。
1996年，经国家科技部批准，学校组建国家小麦工程技术研究中心。
2000年，河南农业大学获得一级学科博士授予学科，成为河南省第一个获得一级博士学科的高校。
2002年，河南农业大学在教育部本科教学评估中获得优秀，成为河南省首个被评为优秀的本科院校。
2003年，批准2个博士后科研流动站，成为本科-硕士-博士-博士后授予权的多层次大学。
2007年8月，河南农业大学“作物学”学科被评选为一级国家重点学科，成为河南省首个一级国家重点学科，也是全国省属院校中唯一一个农学类的一级国家级重点学科
2008年6月，河南农业大学在教育部本科教学评估中获得优秀，成为河南省唯一一个连续两次获得优秀的本科院校。
2009年9月，第七批博士后流动站审批结果公布，新增“林学，畜牧学，农林经济管理”三个博士后科研流动站，至此河南农业大学共有6个博士后科研流动站。
2009年9月29日，河南省省委书记和省长共同出席河南农业大学郑东新区龙子湖新校区奠基仪式，河南省重点建设项目——河南农业大学新校区的开工建设。
2009年11月10日，省政府与农业部合作共建河南农业大学协议签字仪式在郑州举行。这标志着河南农业大学正式进入省部共建行列，成为全国第一个省部共建省属农业大学试点。
2010年9月，省部共建国家粮食作物生理生化与遗传改良重点实验室培育基地获准建立。
2011年1月14日，在北京举行的国家科学技术奖励大会上，河南农业大学作为第一完成单位的两个项目，双双获得国家科技进步二等奖，全省排名第一，全国排名第十六位。至此，河南农大已3年四获国家科技大奖。
2012年4月，河南农业大学成立吴绍骙玉米研究院。
中原学者：张改平、康相涛、郭天财、尹钧、范国强、田克恭、陈彦惠
国家杰出青年科学基金获得者：张改平
教育部长江学者特聘教授：马恒运、汤继华
新世纪百千万人才工程国家级人选：刘文轩、王艳玲、马新明、何松林、汤继华、范国强、张龙现、田克恭
河南省“百人计划”：唐贵良、杜春光
河南省特聘教授：范国强、尹钧、马恒运、吴国良、闫凤鸣、刘小军、张猛、尹清强、杨国庆、陈彦惠、张龙现、李潮海、汤继华、王伟、殷冬梅、赵全志
国家现代农业产业技术体系岗位科学家：余泳昌（大豆）、孙治强（大宗蔬菜）、康相涛（蛋鸡）、王成章（牧草）、宁长申（肉羊）、高腾云（奶牛）、邓立新（肉牛牦牛）、申进文（食用菌）、郭天财（小麦）、李潮海（玉米）
教育部“长江学者与创新团队发展计划”创新团队：小麦生长发育分子调控研究团队（团队带头人：尹钧）、地方鸡种质资源保护与利用（团队带头人：康相涛）
农业部科技创新团队：地方鸡种质资源优异性状发掘创新利用（康相涛）
科技部创新人才支持计划专家：汤继华、赵全志、康国章
教育部新世纪优秀人才支持计划专家：陈锋、宋安东、张小霞、殷冬梅、赵全志、汤继华
国家中华农业英才奖专家：陈伟程、郭天财
国家骨干教师：王艳玲、张全国
全国模范教师：谭金芳、王川庆、赵全志、马恒运
全国优秀教师：尹新明、张国富
全国师德先进个人：王川庆
一级学科国家重点学科：作物学
二级学科国家重点学科：作物栽培与耕作学、作物遗传育种
一级学科河南省重点学科：作物学、林学、生态学、风景园林学、畜牧学、兽医学、农业工程、农林经济管理、植物保护、园艺学、管理科学与工程、生物学、轻工技术与工程、食品科学与工程、农业资源与环境、马克思主义理论
博士后科研流动站：作物学、林学、兽医学、畜牧学、农业工程、农林经济管理
据2018年5月学校官网信息显示，学校获国家教学成果奖6项，国家精品课程7门，国家精品课程资源共享课6门，国家级教学团队1个，国家级特色专业7个，国家级双语教学示范课程1门，国家级实验教学示范中心4个，国家级人才培养模式创新实验区1个，国家卓越农林人才教育培养计划改革试点项目8个，国家级专业综合改革试点3个，国家级大学生校外实践教育基地1个，国家级农科教合作人才培养基地4个，河南省特色专业18个，河南省精品课程18个，河南省实验教学示范中心6个。
国家级教学成果奖：高等农业院校思想道德修养课典范教学法的理论与实践（二等奖）、创建校内“三结合”基地的研究与实践（二等奖）、加强创业素质教育培养农村创业人才（二等奖）、面向21世纪动物医学专业课程体系和教学内容的改革与实践（二等奖）、高等院校卓越农林人才培养的研究与实践（二等奖）、农林高校创新创业教育体系研究与实践（二等奖）
国家级精品课程：兽医寄生虫学、动物微生物学、耕作学、食品工艺学、烟草栽培学、作物施肥原理与技术、园林植物昆虫学
国家级精品资源共享课：作物施肥原理与技术、园林植物昆虫学、兽医寄生虫学、食品工艺学、烟草栽培学、动物微生物学
国家级教学团队：作物学国家级教学团队（带头人：李潮海）
国家级特色专业：农学、动物医学、农业建筑环境与能源工程、园林、植物保护、林学、烟草学
国家级双语教学示范课程：园林植物昆虫学
国家级实验教学示范中心：作物学实验教学示范中心、动物科学实验教学中心、农业工程训练中心、生物学实验教学示范中心
国家级人才培养模式创新实验区：农村发展与管理创业型人才培养模式创新实验区
国家卓越农林人才教育培养计划改革试点项目：“拔尖创新型”（农学、生物工程、农业建筑环境与能源工程、园林）、“应用复合型”（林学、动物科学、农业机械化及其自动化、园艺）
国家级专业综合改革试点：农学、动物医学、农业建筑环境与能源工程
国家级大学生校外实践教育基地：鸡公山农科教人才培养基地
国家级农科教合作人才培养基地：河南农业大学信阳蛋鸡农科教合作人才培养基地、河南农业大学驻马店肉牛牦牛农科教合作人才培养基地、河南农业大学浚县玉米农科教合作人才培养基地、河南农业大学豫中补灌区小麦农科教合作人才培养基地
河南省特色专业：农学、林学、动物医学、植物保护、农业机械化及其自动化、烟草学、动物科学、园林、农林经济管理、农业建筑环境与能源工程、交通运输、食品科学与工程、园艺、农业资源与环境、生物技术、食品质量与安全、土地资源管理、环境工程
河南省精品课程：农业植物病理学、高等数学、马克思主义哲学原理、普通昆虫学、政治经济学、汽车拖拉机学、有机化学、园林苗圃学、企业管理学、工程热力学、动物微生物学、园艺植物昆虫学、动物遗传学、烟草栽培学、作物施肥原理与技术、耕作学、微生物学、作物栽培学
据2018年5月学校官网信息显示，学校建有国家“2011计划”河南粮食作物协同创新中心、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、国家小麦工程技术研究中心、新农村发展研究院、国家农村信息化示范省综合信息服务平台、动物免疫学国家国际联合研究中心、CIMMYT-中国（河南）小麦玉米联合研究中心等7个国际和国家研究平台，国家玉米改良郑州分中心、教育部高校林木种质资源创新和生长发育调控重点实验室、农业部动物生长发育调控重点实验室、农业部农村可再生能源重点实验室、国家烟草栽培生理生化研究基地等64个省部级研究平台。
国家重点实验室：省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室
国家级研究院：国家级新农村发展研究院
教育部重点实验室（培育基地）：教育部作物生长发育调控重点实验室、教育部高校林木种质资源创新和生长发育调控重点实验室培育基地
国家林业局工程技术研究中心：国家林业局农田防护林工程技术研究中心
农业部重点实验室：农业部农村可再生能源重点开放实验室、农业部黄淮海作物生理生态与耕作重点实验室、农业部动物生长发育调控重点开放实验室、农业部黄淮海南部玉米生物学与遗传育种重点实验室、农业部农业微生物酶工程重点实验室、农业部农村可再生能源新材料与装备重点实验室、农业部动物生化与营养重点实验室
农业部观测实验站：农业部黄淮海农业信息技术科学观测实验站、农业部河南烟草生物学与加工科学观测实验站、农业部华北小麦玉米轮作营养与施肥科学观测实验站
河南省重点实验室：河南省作物生长发育调控重点实验室、河南省农村可再生能源重点实验室、河南省动物性食品安全重点实验室、河南省肉制品加工与质量安全控制重点实验室、河南省果树瓜类生物学重点实验室、河南省动物生长发育调控重点实验室、河南省新型农药创制与应用重点实验室
河南省工程技术研究中心：河南省家禽种质资源创新工程研究中心、河南省农村沼气工程技术研究中心、河南省设施园艺工程技术研究中心
河南省工程实验室：速冻米面及调制食品河南省工程实验室、水稻河南省工程实验室、饲料营养河南省工程实验室、农产品冷链物流信息与装备技术河南省工程实验室、河南省害虫生物防控工程实验室、动物生物制品河南省工程实验室
上世纪70至80年代，学校胡廷积、苏祯禄等教授主持全省小麦、玉米高稳低优重大协作项目，促进了小麦、玉米大面积增产，解决了长期困扰河南的温饱问题。进入新世纪，河南农业大学连续主持“十五”、“十一五”、“十二五”国家粮丰工程，先后创造了小麦、夏玉米一年两熟15亩连片亩产全国最高纪录、小麦万亩核心区亩产全国最高纪录、夏玉米同面积世界最高产量纪录，为支撑河南粮食总产量连续突破800亿斤、900亿斤和1000亿斤大关发挥了一定的作用。
玉米中心
陈彦惠
玉米豫综5号等群体的创建、改良及应用
省进步一等奖
机电学院
张全国
南水北调水源保护区生态型发酵气肥联产关键技术及应用
省进步二等奖
信管学院
席磊
吴公害农产品数字化认证平台
牧医学院
李新生
禽流感病毒突变株（H9亚型）HN106株多联疫苗的研制与开发
食品学院
宋莲军
大豆加工特性及其综合利用关键技术研究
省进步三等奖
植保学院
尹新明
控害生物基因的功能研究与开发利用
国麦中心
王晨阳
河南强中筋小麦调优栽培信息化技术研究与应用
王泽霖
禽用浓缩灭活联苗的研究与应用
国家科技进步奖
二等奖
陈红英
鸡鸭白细胞介素-18基因的克隆、表达及在免疫调节中初步应用
河南省科技进步奖
林学院
范国强
四倍体泡桐特性及栽培技术研究
朱玉芳
河南省生态旅游资源环境压力与生态调控研究
张百良
生物质成型燃料技术工程化研究
焦有宙
中小型光合生物制氢连续产氢工艺优化研究
资环学院
王宜伦
夏玉米高产高效施肥关键技术研究与应用
赵卫东
利用基因工程技术开发新型功能性甜味剂的研究
三等奖
图书馆
据2015年12月学校图书馆官网信息显示，馆藏文献总量已达近250万册，其中纸质文献152.05万册，电子图书近100万册，自建有“小麦专题特色数据库”、“玉米专题特色数据库”和“鸡研究特色数据库”等特色数据库，形成了以农业、生物文献为主体，兼有经济、理工、人文、社科等多类型、多载体的馆藏体系。
在1991年全国文献资源布局调查中，该馆农业科学类图书收藏量排名全国第五、生物科学类排名第十。
博物馆
据2015年12月学校官网信息显示，博物馆收藏有植物标本10万多份，涉及近200个科，1200属，4000多种植物，种类数量占中原地区植物种类的70%以上。收藏有昆虫标本15万余号，涉及26个目，近400个科，5000余种，种类数量占中原地区已知昆虫种类的60%以上。收集有动物标本3000多件，其中鸟类标本110余种，占河南已知鸟类的60%。收藏有土壤标本400多个类型。收藏有农业文物和校史资料、图片等1万多件。
该刊先后被CABI，CA，AGRIS，中国科学引文数据库，中国农业文摘，中国生物学文摘等中国国内外10多家数据库和文摘期刊作为固定收录刊源或核心期刊。同时为中国科学引文数据库核心期刊，《中文核心期刊要目总览》综合性农业科学类核心期刊，中国科技期刊方阵“双效”期刊。2010年的影响因子为0.596，并被《中国期刊全文数据库》评为全国8000种期刊的前500强。
该刊曾荣获中宣部、教育部、科技部、农业部、国家新闻出版总署，以及河南省教育厅、科技厅等单位颁发的“全国优秀科技期刊”、“中国高等学校优秀自然科学学报”、“中国高校优秀科技期刊奖”、“河南省优秀科技期刊”、“河南省优秀高校学报”、“河南省自然科学“二十佳期刊””等一、二等奖20余项。
“滔滔黄河岸边，有我们美丽的校园……”每当《绿色颂》的歌声响起，河南农大人立志兴农报国的质朴情感随着歌声流淌而出。这首旋律优美，歌词质朴，意境高远的歌曲正式发布于1999年。
明德自强求是力行
1924年，时任校长常志箴先生提出了“奋发自强求实力行”的校训，经过不断丰富和完善，演变为“明德自强求是力行”。
“明德”语出《大学》：“大学之道，在明明德，在亲民，在止于至善。”自建校伊始，农大人就辛勤耕耘于中原沃野，与大地最为亲近，孕化出大地般的浩然明明之德。这“明明之德”包含了严于律己、宽以待人；守诺重信、脚踏实地；弘农爱国、奋发有为等等丰富的内涵，是河南农业大学以及农大人最为鲜明的特质。“自强”出自《易经》：“天行健，君子以自强不息。”百年农大成长之路曲折蜿蜒，饱受磨难，唯立志以强国、服务“三农”以报国的自强精神激励着农大人矢志不渝、不屈不饶。“明德自强”其意就在于倡导农大人要立德修身，修明胸怀天下之浩荡精气，弘扬奋发图强之壮阔正气，坚忍不拔，勇担重任，富民强国。
“求是”源自《汉书·河间献王刘德传》：“修学好古，实事求是。”“求”是人自觉能动性的表现，是人自己对价值、理想或规律的主动追求和探索，“是”是事物的本质、本源和应有的运行规律。“求是”就是探究事物规律，把握事物本质，发现真理的科学世界观和方法论，是农大人持有的治学和做事态度。“力行”语出《论语》：“好学近乎知，力行近乎仁，知耻近乎勇。”“力”是努力去做，“行”是行动，是实践，是亲身体验。农业教育对实践和动手能力的要求很高，“力行”即陶行知先生讲“知行合一”。因此，“求是力行”蕴含的是农大人遵循规律、探究真知的治学精神，因材施教、身教重于言教的育人理念，尽职守责、实事求是的行事准则和不尚空谈、躬身实践的务实风格。
弘农爱国厚德质朴求真创新包容奋进
“弘农爱国”是河南农大精神的内在本质。“弘农”就是以弘大刚毅的决心和意志大力发展农业，矢志兴农，探寻农业现代化之道，是河南农大在百年风雨历程中始终不渝的责任担当和神圣的历史使命。“天下兴亡，匹夫有责。”“爱国”是河南农大人的天然情感和旷世情怀。无论是反美声援北京，还是的八教授声援学潮等等爱国行动，都是河南农大人谱写出来的一曲曲可歌可泣的爱国民主壮歌。
“厚德质朴”是河南农大人鲜明的人格魅力和道德品质。“厚德”是借大地的无比深厚来形容人的德性的淳朴敦厚，实际上就是大德、深厚的恩德、不计个人得失的宽广胸怀。“质朴”，质朴是一种很自然的状态，用来形容人天真自然，不假饰伪，既如仁者乐山又似善者乐水，任生命纵横往来。
“求真创新”是河南农大学术精神的精髓。“求真”不仅是探究事物规律，把握事物本质，发现真理的科学世界观和方法论，更是学者应有的正确的治学态度。“求真”不仅首先在于探索真理，实事求是，还在于体察天道，认识自然规律，遵循自然规律。农大人以农为本，性情最与天地自然接近，为师者谦和纯厚，为学者务实求真，求真，做真人，是农大人的真实写照。
“创新”是一个形容新生事物生成化育的词汇，就是做出、造就出历史上不曾出现过的东西。“求真”是创新的基础和前提，“创新”是求真的目标和归宿。奠定在求真基础之上的创新，是民族进步之魂，是大学活力之源，它体现了河南农大积极进取、追求进步的精神状态。进入新世纪以来，河南农大以新校区建设为主驱动的跨越式发展及其取得的成效，如实现河南粮食总产量连续十一年创历史新高，连续获得6项国家科技大奖等等就是这座大学求真创新精神的明证。
“包容奋进”是河南农大精神的状态和风貌。“包容”蕴含的是宽阔的胸怀和气魄，其字面的意思宽容、容纳，实质是“仁”，是爱人，是要用心去爱每一个人。包容是和谐的前提，是大爱之源，是良好环境氛围的内生动力。“奋进”，原意为向前奋进，现引申为振奋向前、奋勇前进、奋斗进取，表示河南农大人积极进取向上的精神状态。
团结勤奋严谨求实
“团结”二字其核心讲的是包容、友善、奉献、集体精神，倡导百家齐鸣百花齐放，倡导助人助己己所不欲勿施于人，倡导奉公无私不计回报，倡导众志成城戮力同心；“勤奋”一词其核心讲的是拼、韧、坚三个字，展开来讲“拼”就是勇于任事、用尽全力，“韧”就是顽强不屈、愈挫愈勇，“坚”就是认定目标痴心不改。学海遨游、科技兴农唯有“团结勤奋”方能定品性、成大事。
赵榴明
党委副书记
李成吾
党委副书记、工会主席
副校长
谭金芳
康相涛
尚富德
杨喜田
游舸
创办人
1902年
总办
延祉、胡翔林
约为1902年—1903年
监督
徐仁录
约为1902年—1904年
顾家相
约为1904—1905年3月
启绥
1905年3月—7月
王安澜
1906年9月—1908年6月
刘盥训
1908年6月—1909年7月
毕太昌
1909年7月—1910年7月
张坤
1910年7月—1912年3月
校长
时经训
1912年3月-1912年11月
吴肃
1913年—1917年
陶怀琳
1917年—1918年2月
马全彝
1918年2月—1922年9月
王直青
1922年9月—1924年5月
常子箴
1924年5月—1925年1月
万晋
1925年1月—1925年9月
郭须静
1925年9月—1927年1月
郭桂森
1927年1月—1927年6月
农科主任
郝象吾
1927年8月—1929年9月
王陵南
1929年9月—1930年9月
院长
1930年9月—1931年9月
涂治
1932年—1934年
1934年—1941年9月
陈植
1937年
1941年9月—1946年8月
王鸣岐
1946年8月—1949年7月
刘潇然
1950年8月—1954年8月
党支部书记
赵树材
1950年5月—1953年11月
党总支部书记
李升阁
1953年11月—1957年9月
党委书记
宋辛夷
1957年9月—1967年9月
许西连
1956年5月—1967年9月
革委会主任
郝福鸿
1972年12月—1975年7月
冯若泉
1975年8月—1977年8月
宋寅
1978年1月—1979年10月
1978年1月—1983年9月
代院长
1982年1月—1983年9月
副院长
吴绍骙
1949年12月—1983年9月
名誉校长
1984年12月—1994年3月
蒋建平
1983年9月—1994年5月
1983年9月—1991年3月
1991年3月—1994年5月
1994年5月—2003年10月
李友忱
1994年5月—1997年8月
张广智
1997年8月—2003年2月
赵鹏
2003年2月—2008年3月
王艳玲
2003年11月—2009年3月
程传兴
2008年3月至今
张琼
2009年3月——2013年8月
陈伟程：河南农业大学教授，玉米遗传育种专家。
杨效文：任莱斯特大学医学院蛋白表达实验室主任。
朱坤明：河南省民政厅副厅长69级牧医校友。
本专业学生主要学习生物环境工程、建筑工程与农村能源方面的基本理论，偏向于热工、新能源多一点，是一个比较杂的综合专业。就业情况还好，主要看个人意愿。
园林专业属于学校的老牌专业了，各方面水平都还不错。学生主要学习生态学、园林植物、观赏园艺、等方面的知识，毕业以后可以从事风景区、森林公园、城镇各类园林绿地的规划、设计、施工、园林植物繁育栽培、养护及管理等工作。
农大的植物保护专业还是不错的，考研率很高，植物保护专业在学校地位处于中游偏上，很不错。毕业以后可以从事植物保护工作的技术与设计、推广与开发、经营与管理、教学与科研等工作。
河南农业大学的烟草专业是全校的一流专业，只是就业形势和别的专业差不多，必须得学得好。学校期间主要学习烟草生产、烟草遗传育种以及烟叶质量检测与经营管理等方面的知识。可从事与烟草有关的技术与设计、推广与开发、经营与管理、教学与科研等工作。
河南农业大学林学专业具有国家林业局重点学科“森林培育”，全国有名，学生主要学习森林培育、森林病虫鼠害防治、野生植物资源开发等知识。毕业后可以从事森林培育、森林资源保护、森林生态环境建设等工作。