1、作用不同。增值税专用发票不仅是业务凭证，还是计算抵扣税款的法定凭证，购货方可以依据发票上的税额抵扣销售税额，而普通发票不可以。除税法特殊规定外，普通发票不得进行增值税进项抵扣，这也是专票区别于普票的最本质特征；
2、票面不同。专票是三联式的，分别为，记账联、抵扣联和发票联。普票是二联式的基本联次，分别为发票联和记账联；
3、开具范围不同。专票开具范围要小一点，不是什么业务都能够开具增值税专用发票的，有一些特殊的经营行为，就不允许开具增值税专用发票；也不能开具增值税专用发票。普票开具范围最广泛，一般的经营业务都能开具增值税普通发票；
4、免税政策不同。小规模企业每季度有45w普票免税额度；专票不享受免税政策，但也会占用这个额度；
5、抵扣权限不同。专票可以抵扣增值税，普票不能抵扣；
7、税率不同。普票的税率一般是1%和3%，专票不止有1%、3%，还有6%、9%、13%的税率。
专票3%的税率可以抵扣吗？
专票3%的税率是否可以抵扣，取决于取得发票的主体和具体情况。以下是详细介绍：
1、一般纳税人取得3%的增值税专用发票可以抵扣进项税。
2、小规模纳税人取得3%的增值税专用发票也可以按3%抵扣进项税。
3、一般纳税人取得小规模纳税人在国税代开的增值税专用发票，可以按3%抵扣进项税。
4、一般纳税人取得的是增值税普通发票或者是增值税专用发票开票内容是用于发放员工福利的，则不可以抵扣。
5、还有一些特殊情况，例如疫情期间，取得1%专票农产品专用发票可以按照9%/10%计算抵扣，但目前，取得农产品1%专票，不能按照9%进行抵扣。具体执行可能因地区而异，建议咨询当地税务机关获取准确信息。
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