燃气热水器中水垢的清洗方法主要是将专用清洗剂注入到热水器内部，经过浸泡再冲洗就可以了，没有必要拆机。具体步骤如下：
1、准备工具和材料
工具：改锥、活口扳手、大号注射器（或专用注射工具）、排水软管
材料：热水器专用清洗剂（建议购买食用级的柠檬酸类的清洗剂）
2、切断电源、关闭燃气阀、进水阀
把要用到的工具材料准备好后，先将热水器的电源拔掉，关闭燃气阀门，关闭进水阀门，确保热水器处于断水、断电、断气的状态，防止在清洗的时候启动。
3、排水
将热水花洒或水龙头打开，进行排水。并将进水口的泄水阀打开，这样热水器内的水就完全排出了。这里注意有的热水器排水阀可能在出水口，也有的进水口是一个过滤器，也有的装的是安全阀，不管哪一种，只要打开，有空气进入就可以将热水器内的水全部排出。
4、注入清洗剂
将热水器里面的水排完之后，我们现在要将清洗剂注入到热水器内。有很多方法，一般是从进水口处的泄水阀处注入。可以采用专用门设计的注射方法，也可以连接一个小水泵，还可以使用最简单的大号注射器。具体的清洗剂浓度，根据你买的清洗剂说明来，有的是粉末状的需要提前稀释。
注入清洗剂的时候，建议将热水管也一并注入清洗剂，直到整个热水系统和热水器内部全部注满。这里也应注意热水器，一般安装的比较高，而我们的水龙头或花洒，没有热水器的位置高，进入的清洗剂会流出来，我们要采取相应的措施，保证清洗剂不流出，并且充满热水器。具体的方法，很多，比如将水管放高一点，及时关阀门等等。咱就不过多的说了。
5、浸泡
6、排污冲洗
浸泡完成以后，打开热水水龙头，打开进水阀，利用自来水的压力对热水器及热水管路进行排污和冲洗。这里不建议用花洒，阻力大，还容易滞留污垢，我们直接用水龙头，或者直接是出水管最好。建议冲洗5分钟以上，将全部污垢和清洗剂冲洗出来。清洗完成。
按照以上6个步骤，可以说就能对燃气热水器的水垢进行清理。不过，我们在实际清洗的过程中，可能要重复多次注入清洗剂、浸泡、排污冲洗的步骤，以达到最好的清洗效果。
不过，不论采用任何方法对燃气热水器进行清洗，因为采用了酸性的清洗剂，都会对热水器内部有一定的腐蚀，这个是在所难免的。所以咱们使用燃气热水器的时候，建议前端加装净水设施，保证水质，才是最佳的选择。