清华大学新闻系依托日益增强的新闻学和传播学的学科基础和精干的师资团队在国际传播、媒体与科技、艺术相结合和影视理论与批评等方面的学术研究中取得一定的优势。
清华大学艺术设计学院是我国最早成立的设计类学院，学院在全国艺术院校当中处于领先地位。连续两次被美国《商业周刊》评为全球60所最佳设计院校之一。以设计艺术学为主体的艺术学一级学科在5年一次的全国一级学科评估中，于2004、2009年两度全国排名第一。
清华大学微电子学与国内同类学科相比，其物质条件与基地建设、科研水平与成果及学生培养规模与水平均居全国前列。在2006年全国一级学科评估中，该系隶属的“电子科学与技术”学科获得了“整体水平”第一名的好成绩。
清华大学工程物理系是我国培养高素质核科技人才的主要基地。师资力量雄厚，科学研究十分活跃，取得了多项重大成果，为世人所瞩目，研究经费增长了近十倍，综合科技效益位列全国同专业之首。毕业生深受社会欢迎，就业前景良好。
清华大学电子工程系是我国最早从事信息与电子科学技术教学和研究工作的单位之一，在2002年、2006年全国一级学科整体水平评估中均排名全国第一。在USnews国际学科评估中，电子系排名世界第24名、国内第1名。是全国学科最全、综合性最强的电子工程专业。
清华大学计算机科学与技术系，已发展成为我国计算机学科领域内教学、科研综合实力强，影响力大的计算机系。2002年在全国学位与研究生教育发展中心开展的一级学科整体水平评估中，计算机系在总共4个分项指标中，3项(学术队伍、人才培养、学术声誉)在全国排名第一。2006年在全国学位与研究生教育发展中心开展的一级学科整体水平评估中，以总分满分100分的成绩排名第一。
清华大学软件学院充分发挥清华大学在信息工程领域的综合学科优势，先后承担国家核高基、863、973和国家自然基金等多个重大科技攻关项目。聚集海内外优秀人才，通过整合资源、完善机制壮大师资团队。
清华大学电子信息工程拥有水沙科学与水利水电工程国家重点实验室，综合实力强，水利工程在首次一级学科评估中排名全国第一。师资力量雄厚，学生就业前景广阔
清华大学化学系与兄弟院校的化学专业相比，依托清华大学强大的工科平台，更注重学科交叉和理工结合，涵盖了现代化学的各主要领域，尤其着眼于21世纪化学发展的最新生长点。清华大学化学系招收的本科生数量在全国知名大学化学院系中规模最小，著名教授比例却非常高，因而师生比在全国知名化学院系中最高，在1v1辅导方面的条件得天独厚。
清华大学自动化专业在教育部学位与研究生教育发展中心于2003年、2006年和2012年组织开展的三次一级学科评估中，清华大学电气工程学科均名列第一。电网的快速增长给“电气工程及其自动化”专业的学生提供了大量就业岗位。
机械工程系创建于1932年，是清华大学最早组建的工科系之一。拥有多个国家重点实验项目，使机械工程系的科研教学环境再上一个台阶，在最近的全国重点学科评审中名列第一。
清华大学热能工程系紧跟世界科技发展的前沿水平开展基础研究，有多项重要的国家科研任务和省部级科研项目以及企业委托技术开发项目。近年来全系共获国际金奖1项，国家发明奖5项，国家自然科学奖1项，省部级科技进步奖63项。
清华大学建筑系清华大学建筑学专业是我国最早的建筑学专业之一，从梁思成先生1946年创建至今，一直在全国建筑教育中处于引领地位，在2003年、2008年、2012年教育部全国一级学科评估中，连续三次获得第一名。学科领衔的吴良镛院士在2011年以其人居科学理论获得了国家最高科学技术奖。
清华化工系首批通过国务院重点学科及一级学科评审。全国开展的第一次化学工程学科评估，清华化工系是第一名；在2001年全国重点学科评审中，化学工程学科继续保持100%的通过率，位居第一；中国科学院开展了一次关于研究生培养的教学评估，清华化工系是高等院校的第一名。截止2002年底，化工系恢复建系后的毕业生中已产生中国科学院院士和工程院院士各1名，国家杰出青年基金和长江学者共5名，中国青年科技奖1名，政府部门、大学及大型国企领导及技术负责人多名。
清华大学数学与应用数学是国内与国际水平相差最小的专业。清华大学数学系依托校内优越的理学背景，以人为本在国内同专业中处于领先地位。师资力量除了本土学者以外，近年来引进了一些国外一流大学数学系的著名数学家。学生有机会在本科阶段接触到国际数学前沿和国际一流的数学家。这为他们继续深造创造了很好的国际关系。
工程管理是清华大学最具优势和历史的学科之一，也是最受用人单位欢迎的学科之一，师资力量雄厚，拥有国际视野
清华大学英语专业培养具有较扎实的英语语言知识基础、较优的英语语言运用能力和广泛的人文，科技、经贸等专业基础知识的高级英语人才。毕业生在人才市场上历年保持较强的竞争优势，具有可塑性好、适应能力强等特点，受到用人单位的广泛好评和欢迎，其中不少人已成为各行各业的骨干。
清华大学物理系在凝聚态、天体物理、原子物理等方面是世界一流的，是不输北大物院的，物理系近几年的科研成果也是非常好的。核科学与技术”一级学科全国评估排名第一，并被评为首届全国一级学科重点学科。工程物理系积极开展国际合作和学术交流，开阔学生的国际化视野、提高学生的国际交流能力。
清华大学建筑环境与设备工程2001年被评为全国重点学科，同时供热供燃气通风与空调专业被评为该专业首个全国重点学科；2003年全国学位与研究生发展中心进行全国一级学科评估，建筑学院获得建筑学一级学科评估第一名。2000－2003年四年中，建筑学院共完成纵向和国际合作科研项目28项，其中包括国家自然科学基金重点项目，在国内有广泛影响。
精密仪器系在国内首批开设测控技术与仪器专业，拥有国家重点实验室、国家工程中心、教育部重点实验室、清华大学教学实验中心、以及与企业合建的联合实验室、教学联合实验室等基地；拥有全国最早设立的仪器科学与技术、光学工程等两个一级学科博士点和博士后流动站，是国内首批工程博士和工程管理硕士的授予单位；应届毕业生每年约65%的学生获得免试继续攻读博士或硕士研究生的资格。
生物医学工程专业是具有学士、硕士及博士授予权的一级学科，并建立有独立的博士后流动站，2002被评为国家重点学科。2002年由全国学位与研究生教育发展中心开展的一级学科整体水平评估中，本专业在“学术声誉”方面得100分，列全国同类专业第一。
清华大学工业工程系特聘美国工程院士担任系主任何讲师，科研成果较多，2011年国际学科评估中，该系被认为达到了美国前十的水平，部分领域已经是国际领先的水平。
清华大学电气工程及自动化师资力量雄厚,有学术造诣高深的老一辈知名专家学者。曾获得国家教学成果特等奖,“电气工程及其自动化专业建设”获国家教学成果二等奖,共获得26项国家科技奖100多项省部级科技奖和50多项国家专利。在1998年和2002年的全国重点学科评审中,均以四个重点学科的优势成为全国高校同类系中重点学科最多的系。
土木工程系是清华大学最早建立且学科应用面最广的院系之一，是首批国家级一级重点学科，先后有28位院士和12位国家级工程设计大师在此学习和工作过。在QS全球分学科排名中，土木系单科排名全球第15位。在新近完成的土木水利学科国际评估中，被评价为：“不论从本科生到研究生，从课程设置到研究培养，在世界上都处于顶尖地位”。
清华大学环境工程系被国家教委和国家环保局授予“全国环境教育先进单位”荣誉称号，获“北京市环境保护先进集体”荣誉称号，同时被国家环保局授予“全国环境保护科技工作先进集体”，获首届“中华环境奖”提名奖。在重点学科评估中名列环境科学与工程一级学科第一名和环境工程二级学科第一名，成为我国环境保护高层次人才的培养基地和科研中心。本系毕业生可到中央、省市地区及工业部委的环境保护与市政建设（给水排水）部门和有关工厂企业从事环境污染控制和给水排水的规划、设计、科研、教学和技术开发、管理等工作。
清华大学工程力学与航天航空工程以著名科学家钱学森先生为代表的一大批著名学者了学科的发展付出了他们的努力和睿智，从而奠定了学院发展的坚实基础。航院的师资力量雄厚，是清华大学研究生在读人数较多的学院之一，是层次齐全的培养航空航天、力学和工程热物理技术科学方面高级专门人才的重要基地。
清华大学生物系拥有一支知名的、充满活力的教师队伍，曾为我国培养了一大批知名的生物学家，中科院生物学部的院士中有30余位曾就读于清华大学或在清华大学工作过。1999－2004年，清华生物系连续被评为“全国理科（生物学）基础科学人才培养优秀基地”；2004－2005年“国家生命科学与生物技术人才培养基地”连续两年被教育部评为优秀基地。