北京交通大学目前有国家级一流本科专业建设点47个（所有本科招生专业全覆盖），北京市级一流本科专业建设点5个，北京市重点建设一流专业3个，详见下表：
序号
本科招生专业（类）
包含的国家级一流本科专业建设点
1
自动化类
轨道交通信号与控制、自动化
2
电子信息类
通信工程、电子科学与技术、信息工程
3
计算机类
计算机科学与技术、信息安全、物联网工程
4
经济管理试验班（经济类、管科类）
物流管理、信息管理与信息系统、经济学、金融学、工程管理、保密管理
5
经济管理试验班（经管学院工商类）
会计学、财务管理、工商管理
6
交通运输类
交通运输、交通工程、电子商务、物流工程
7
土木类(智慧建造与智能工程）
土木工程、铁道工程
8
机械类(智能制造与智能装备)
车辆工程、测控技术与仪器、机械工程、工业工程、能源与动力工程
9
机械电子工程（中外合作办学）
机械电子工程
10
电气类
电气工程及其自动化
11
理科试验班(数学与统计)
信息与计算科学、统计学
12
理科试验班(智能光电与纳米技术)
光电信息科学与工程、纳米材料与技术、应用物理学、工程力学
13
纳米材料与技术（中外合作办学）
纳米材料与技术
14
外国语言文学类
英语、西班牙语
15
新闻传播学类
传播学、网络与新媒体
16
软件工程
17
建筑类(建筑与规划)
建筑学
18
设计学类
视觉传达设计、环境设计、数字媒体艺术
19
法学
20
环境工程(智慧环境与低碳技术)
环境工程
包含的北京市级一流本科专业建设点
理科试验班类(数学与统计)
数学与应用数学
葡萄牙语
城乡规划
包含的北京市重点建设一流专业
轨道交通信号与控制
物流管理
交通运输
二、国家级特色专业
北京交通大学目前有11个专业入选国家级特色专业，详情见下表：
包含的国家级特色专业
自动化
通信工程
计算机科学与技术
物流管理、经济学
交通运输、交通工程
土木类(智慧建造与智能工程)
土木工程
车辆工程
三、通过国家专业认证（评估）的专业
北京交通大学目前已有13个专业通过国家工程教育专业认证，3个专业通过国家住房和城乡建设部专业评估，详见下表：