“OnePiece”在故事中为“宝藏”之意。故事描述男主角蒙奇·D·路飞为了当上“航海王”而踏上“伟大航道”及与其伙伴的经历。传说中‘海贼王’哥尔·D·罗杰在死前说出他留下了具有财富、名声、力量世界第一的宝藏“OnePiece”，许多人为了争夺“OnePiece”，争相出海，许多海贼开始树立霸权，而形成了“大海贼时代”。十年后，路飞为了要实现与因救他而断臂的四皇‘红发’香克斯的约定而出海，在遥远的路途上找寻着志同道合的伙伴，一起进入“伟大航道”，目标当上“海贼王”。该漫画在世界各地大受欢迎，至今还在连载中，在日本漫画周刊《周刊少年Jump》中占据人气榜的第一位。
日本集英社正式宣布，“海贼王”漫画第59集，已成为日本图书出版史上初版发行量最高的作品。初版发行量高达320万册。日本单行本的累积发行数量已达1亿9500万册以上，并在日本以外的二十多个国家发行。
第一季东海故事
蒙卡篇（动画：1话－3话）蒙奇·D·路飞童年时受到海贼红发香克斯的启蒙，自小就立志要成为“海贼王”。十年后，年仅17岁的他，戴着红发香克斯托付的草帽，只身从故乡风车村出发。途中他遇到在“亚尔丽塔海贼团”打杂的少年克比，在打倒海贼团的船长“铁棒”亚尔丽塔后，路飞得知东海有个外号“海贼猎人”的剑士罗罗诺亚·佐罗，并想要拉拢他成为伙伴，遂与克比两人来到被海军上校“斧手”蒙卡统治的谢尔兹镇。由于佐罗曾在镇上砍杀了蒙卡上校的儿子赫鲁梅伯所饲养的狼犬，在被拘捕后即将被处死。佐罗被路飞的气势折服，并合力打倒蒙卡上校。佐罗正式成为了路飞的第一个伙伴，而克比在路飞的帮助下也如愿成为了海军。
巴奇篇（动画：4-8话）索隆成为路飞的第一个伙伴，他们来到海贼巴奇控制的城镇，在那里遇见痛恨海贼的小偷娜美。克洛篇（动画：9-18话）娜美作为他们的航海士与他们两人合作（不过她强调不是他们的伙伴），他们来到一座岛并寻找可以使用的船，在那里他们遇到骗人布。然而他们却发现骗人布的朋友可雅的管家古拉哈诺（克洛船长）欲杀害可雅，路飞等打败了克洛后，可雅将黄金梅利号赠予他们。
第二季东海故事
克利克篇（动画：19-30话）狙击手骗人布成为路飞的伙伴，一行人来到海上餐厅巴拉蒂，希望能找一个厨师伙伴。但是餐厅却受到克利克的攻击，原来克利克从伟大航道回来后，船已破损不堪使用，他想要夺取巴拉蒂，再度返回伟大航道。
恶龙篇（动画：31-45话）来自巴拉蒂的厨师黑脚香吉士加入的草帽海贼团，但是娜美却偷了他们的船，他们尾随娜美，来到鱼人海贼恶龙所控制的岛屿。娜美坦承她是恶龙海贼团的一员，并且帮助路飞他们只是为了偷取黄金。但实际上，娜美是为了从恶龙手上买下她的村子而忍辱在恶龙底下工作。后来，路飞打倒恶龙后，航海士娜美加入了草帽海贼团。
罗格镇篇（动画：48话－53话）路飞一伙人到达了罗格镇，这是进入伟大航道之前必经的地方，也是‘海贼王’哥尔·D·罗杰的故乡和后来被公开处刑的所在，因此这里又被称为“开始与结束的城镇”。在罗格镇，他们同时受到管辖这里的海军上校‘白猎人’斯摩格和其他许多敌人的夹击，路飞在奔走过程中撞见了海贼王被处死的高台，兴奋的爬上高台眺望远方，却不小心被小丑巴奇给擒住。巴奇手上的刀即将招呼到颈间的那一瞬，路飞笑着对草帽海贼团团员说：“对不起，我要死了！”，此情景令斯摩格回想起二十年前海贼王的处刑（死前能够没有遗憾的笑，这样的人并不多）。
也许是身处高处的缘故，巴奇的刀凑巧引来了闪电劈向高台，身为橡胶人的路飞因为身体不导电而得救了，巴奇则是暂时昏迷。返回船上的路上，路飞在镇上的入口处一度被斯摩格抓住，却又受到父亲‘革命家’蒙奇·D·多拉格的帮助而得以脱身（当时路飞并不知情）。离开罗格镇后，一伙人在伟大航道的入口──颠倒山之前以各自的梦想立誓，跨越颠倒山之后进入了伟大航道，展开下一段冒险。
第二季伟大航路之阿拉巴斯坦事件
颠倒山篇（动画：62－63话）草帽海贼团一行人来到伟大航道双子岬，在那里遇到一只等待留下它去了伟大航道的伙伴50年的‘岛屿鲸’拉布，还有一位是曾在‘海贼王’罗杰船上当过三年船医的可乐克斯（不过当时一行人并不知道可乐克斯曾在海贼王船上待过，现在的可乐克斯是双子岬灯塔看守员），还遇见神秘的二人组‘Mr.9’和‘Miss星期三’想取得拉布的肉当粮食，所幸及时被路飞阻止，本想逃跑的两人却不慎遗失了纪录指针而无法回到他们的基地，之后两人便请求刚得到新纪录指针的草帽海贼团搭船载他们回去。
威士忌山峰篇（动画：64－67话）在‘Mr.9’和‘Miss星期三’的带领下，草帽一行人来到威士忌山峰，在那里市民举行派对欢迎他们的到来。后来得悉威士忌山峰是秘密犯罪组织·巴洛克华克的地盘，在‘Mr.5’和‘Miss情人节’的追捕下发现‘Miss星期三’和‘Mr.8’的真实身份其实是阿拉巴斯坦王国公主娜菲鲁塔利·薇薇和阿拉巴斯坦护卫队队长伊卡莱姆，从公主口中得知阿拉巴斯坦正处于水深火热之中，以及王下七武海‘Mr.0’沙·克洛克达尔的阴谋后，因此决定帮助这位公主（起初看在10亿贝里的份上，只是答应护送）。
后伊卡莱姆变装成薇薇的样子并带着前往阿拉巴斯坦的永久指针，设法假冒草帽海贼团直接回国，让一行人平安离开威士忌山峰，却仍被巴洛克华克派来的‘MissallSunday’妮可·罗宾给识破，但MissallSunday没有接到任何要杀死薇薇的指令，并只将前往阿拉巴斯坦的永久指针交给草帽海贼团后就离开了，而路飞因不信任MissallSunday而将永久指针破坏，并依循原持有的记录指针往小花园前进。
小花园篇（动画：70－77话）路飞一行人来到小花园，那里是一个仍然保存著史前时代景观的巨大岛屿。但在那里有着比恐龙更加恐怖的东西，那就是已经在岛上决斗超过100年的两位巨人‘青鬼’东利和‘赤鬼’布洛基。
众人更在此遇上了巴洛克华克的高级特务‘Mr.3’和‘Miss黄金周’。
一行人会合后两位巨人并以最强的绝招“霸国”在食岛怪身上开了个大洞，护送他们离开。
磁鼓王国篇（动画：78－91话／剧场版9）由于奈美得到一种不知名的病（其实是被在小花园的蚊虫叮咬），使得全员必须前往有医生的岛屿寻找医生，但在此时，他们又从三天前的报道中得知阿拉巴斯坦的内乱越来越严重，身为一国公主的薇薇担忧著国内一百万名国民的性命，因此希望在治好奈美的病后让船以最快的速度航向阿拉巴斯坦。于是一行人来到了有“医疗大国”之称的磁鼓岛，不巧的是磁鼓岛因为先前统治者的关系，使得岛上只剩下一个医生，那就是住在山上城堡里的‘魔女’Dr.古蕾娃，路飞和山智背着重病的奈美为此踏上征山之途，途中受到一大群“食肉兔”和“雪崩”的影响，山智为了掩护路飞而受重伤，路飞带着两人徒手爬上Dr.古蕾娃所在的磁鼓山，但由于穿着单薄导致严重冻伤晕倒，三人一起接受了Dr.古蕾娃的治疗，并在此遇见了她的助手，一只蓝鼻子的驯鹿多尼多尼·乔巴。
路飞想拉拢乔巴成为自己的伙伴，但乔巴因为过去的心灵创伤而不愿与人类接触，与此同时，前统治者海贼团船长‘白铁’瓦波尔刚好回到磁鼓岛来抢回他的国家。
在经历与瓦波尔的战斗后，乔巴决定和路飞等人出海，乔巴以船医身份加入草帽海贼团。
阿拉巴斯坦篇（动画：92－130话／剧场版8）一行人和公主薇薇来到了阿拉巴斯坦，原先打算至叛乱军基地犹巴直接劝阻叛乱军首领寇沙，抵达时却发现叛乱军已经离开。
在路飞的决定下前往克洛克达尔的所在地雨地，得知其夺取国家的计划理想国后，便赶回首都阿尔巴那。在他们抵达阿尔巴那时，内战已经开始了，一行人为了使薇薇到达皇宫与巴洛克华克展开激战。
路飞先后被克洛克达尔打败了两次，最后于遗迹里成功打败他，其他成员亦击败巴洛克华克的一众高级特务。而最后的一场雨使得薇薇得以向大家说明‘Mr.0’克洛克达尔的阴谋，内战亦随之结束。其后薇薇和跑得快向路飞等人道别，就算脱离了海贼团但仍是伙伴之一。
原·巴洛克华克副社长妮可·罗宾，在解了路飞的毒后，因失去人生目标想寻死却被路飞所救，无处可去而被路飞收留，以考古学家的身份加入了草帽海贼团。
第二季伟大航路之SKYPIEA篇加亚篇（动画：144－152话）离开阿拉巴斯坦王国之后，想要前往下一个岛的草帽一伙意外发现一艘从天而降的大船。诡异的是，纪录指针竟然向上指向天空。
路飞也在大船上找到一张“空岛”的地图，先前没有预料到会有如此状况的一伙人来到了加亚岛，路飞、佐罗、奈美三人前往岛西“魔谷镇”镇上的酒吧，想要打听有关“空岛”的线索，但遭到“鬣狗”贝拉密及其海贼团一伙人嘲弄。贝拉密等人对路飞拳打脚踢，甚至讥笑所谓的“空岛”只不过是白日梦而已，但路飞对佐罗说“这场架打不得”，以毫不还手诠释了他对梦想的坚信不疑。在酒吧外的“黑胡子”马歇尔·D·汀奇后来跟奈美解释：“这场胜负是你的伙伴赢了”，接着透过罗宾从魔谷镇得来的情报得知，加亚岛有个被居民逐出魔谷镇的怪老头库力凯，他似乎知道到达空岛的方法。从岛西的城镇离开后，他们来到加亚岛东部的海岬，遇到了四百年前被称为骗子的蒙布朗·诺兰德的子孙－猿山联合军船长蒙布朗·库力凯，得知了上升海流下次的爆发地点在加亚岛南方后，全员前往森林想要捕捉一只名叫指南鸟的生物帮忙指引方向，回来后却发现库力凯的黄金遭到先前发生冲突的贝拉密强夺。
第二季伟大航路之突破海军要塞（196-206）
突破海军要塞（动画：153－195话）飞也似地逃离空岛的路飞一行人，让空岛的人们没有机会向他们说声谢谢及再见，不过在响彻云霄的钟声中，以及柯妮丝释放的章鱼热气球让他们顺利离开了空岛，但是快降落时却又发生了意外，由于章鱼突然缩小让他们摔到了莫名的地方……在柯妮丝的帮忙下，路飞他们总算是平安降落了但是降落的地点却很不妙，因为竟然是他们海贼团的死对头海军要塞，不过路飞等船上的船员却都没有在船上，让这个要塞的司令官以及其它官兵都觉得匪疑所思，甚至怀疑这是幽灵船……
路飞一行人分散之后，各自在这个叫做拿巴隆的要塞中寻找出路，没想到香吉士与路飞误打误撞被当成新人的大厨师叫进了海军厨房，并且紧接着与海军厨师展开了一场战斗，不过以香吉士的技术当然是让人叹为观止……
各自分散的路飞等人，娜美将自己乔装成打扫人员，路飞和香吉士则是假装成厨师混在大食堂中只有独自一人的索隆被抓住了，另一个落单的乔巴也在千钧一发之际被送到了医务室，就这样阴错阳差之下乔巴为受伤的海军动手术。
与路飞他们分散后，骗人布原本和妮可罗宾一起行动，后来因为骗人布心急地想先找到黄金梅利号受不了罗宾一直在调查拿巴隆要塞的事，一个人跑到整备队的船坞，却因此被德雷克少校抓到，原本打算伪装成特别监察官的他，偏偏碰上了已经伪装成特别监察官的罗宾……由于罗宾的计谋让骗人布也被抓走了牢里，因为她认为骗人布和索隆在一起比较安全，另一方面路飞和香吉士则是朝向最有可能的地方，一心想要救出被抓到的两人，没想到这却又是强纳森司令官设下的陷阱，幸好有骗人布的冲击贝才能爆破监狱救出了骗人布与索隆。
再次回到海军要塞的路飞等人，在骗人布的安排下兵分两组行动，首先是路飞，骗人布，索隆及罗宾为夺回黄金小队，而娜美和香吉士则是回收威霸小队，结果又只剩下乔巴一个看守黄金梅利号。不过强纳森司令官也不是省油的灯，早就拟好作战计划等他们来……
兵分两路的路飞等人，娜美与香吉士很快就顺利找到了威霸，但是路飞他们好不容易找到保险库却发现里面空无一物，在整备队的梅卡欧大叔的暗示下，娜美猜到了强纳森司令官一定是把黄金放在最明显的地方，那就是司令官办公室。原来以为已经成功夺回黄金的路飞等人，却在要逃出拿巴隆要塞时遭遇到空前的危机，由于这个要塞天然的屏障与地形，在退潮时任何船只都无法通过，让黄金梅利号也被困在浅滩上无法动弹。幸好路飞他们想到，利用冲击贝与章鱼再次升上天空……别了海军要塞！
第二季伟大航路之司法岛事件
长环岛篇（动画：207－228话）结束空岛的冒险后，草帽一伙在海上遇到一艘既没有帆也没有旗帜的海贼船，还因为少了指挥一切的船长和航海士让船员变的没有组织性，整艘船并在一行人面前遭到海猴子引起的巨浪吞噬。接着他们来到了长环岛，遇到狡猾的海贼团船长“银狐”弗克西，拥有“迟缓果实”能力的弗克西向路飞挑战“DavyBackFight”比赛，胜利者可以从败方选择得到一名成员或选择标志（被夺走标志后不得再挂上该标志，以及被夺走的同伴、标志等，都必须在由“DavyBackFight”夺回）。草帽海贼团与弗克西海贼团比了两场，分别为“环形赛船”及“火爆斗球”，在一胜一败的情况下进入第三场也就是最后一场的比赛，第三场是“双方船长一对一决斗”，弗克西的迟缓能力一度让路飞居于劣势，最后因为想要守护所有伙伴的心意以及爆炸头的野性力量爆发让他战胜了弗克西。事情结束后，他们又遇上了海军本部上将“青雉”，而他的目的，就是要歼灭曾经从他手中逃走的罗宾。为了保护罗宾，一行人和这个可怕的强敌战斗，败得一塌糊涂，最后却被放过一马。遭到青雉“冷冷果实”能力攻击导致全身被冰冻的罗宾和路飞，则在团员们的合力抢救下捡回一命。
第二季伟大航路之罗宾争夺战篇
罗宾争夺战篇（动画：242－262话）草帽一伙进到艾斯巴古的宅邸，发现幕后驱使罗宾的主谋竟是世界政府直属秘密间谍机关“CIPHERPOLNO.9”，但因为他们超人般的力量“六式”使众人很快就吞下败仗。CP9逼问艾斯巴古古代兵器“冥王”设计图的去向，并以假设手法得知应该在弗兰奇那儿，刚好撒谎布也在弗兰奇那里，两个人就跟罗宾一起被抓上海上列车“冒烟汤姆”。奈美也从艾斯巴古口中得知了一件惊人的真相，原来罗宾之所以背叛草帽一伙，是为了让他们平安离开水之七岛；打从心里将草帽一伙视为重要伙伴的罗宾，打算牺牲自己的性命以保护伙伴们免于受世界政府“非常召集”攻击。于是，草帽海贼团、弗兰奇家族与卡雷拉公司等人决定要去救回牺牲自己的罗宾和被抓走的弗兰奇，而和众人暂时分开行动的山智则潜入了海上列车，解放了撒谎布和弗兰奇，与各“CP”进行激烈的争夺战。弗兰奇为了让山智他们顺利把罗宾带回去而牺牲自己让CP9给抓回去，但罗宾却仍选择了离开众人，和CP9一起到司法之岛“艾尼爱斯大厅”。
第二季伟大航路之司法岛篇
司法之岛篇（动画：263－312话）一行人来到了世界政府辖下的司法之岛“艾尼爱斯大厅”，弗兰奇安排让妮可·罗宾与路飞见面，但罗宾仍不愿意回到伙伴身边，还告诉路飞自己已经不想活了。
罗宾揭露出世界政府的阴谋及以往的所作所为，害她家破人亡，甚至被逼的走投无路而想寻死。得知罗宾痛苦的草帽海贼团当着司法岛所有人面前，烧毁了代表世界政府的旗帜（向全世界宣战），此举让罗宾当场放声痛哭，并且大喊出了压抑在心中许久的心愿-“想要活下去”。弗兰奇拿出冥王设计图并当着众人的面前直接烧毁此行惹怒斯潘達姆而被一脚踢下司法之塔后来海上列车“火箭人”冲进司法之塔之时成功救回弗兰奇，但却没有救回罗宾。
第二季伟大航路水之七岛后篇
原来，在此前几天，白胡子海贼团的第二队队长“火拳”波特卡斯·D·艾斯与“黑胡子”马歇尔·D·汀奇在巴纳洛岛上发生了激战，此战胜负成了日后某件“大事件”的导火线。
第二季伟大航路之迪巴鲁篇
迪巴鲁篇（动画：386－389话）离开“魔幻三角地带”后，已经航行伟大航道半圈的草帽海贼团终于看到了“红土大陆”，大伙对一直以来的辛苦航行而获得的代价感到相当欣慰。为了寻找到鱼人岛的线索，他们利用“鲨鱼潜水3号”潜入海底探索却无功而返，此时一只直追鲨鱼潜水3号的海兔跳出海面攻击草帽海贼团，路飞打倒海兔之后，意外遇见从海兔嘴里掉出来的人鱼海咪和海星帕帕克。两人拜托草帽海贼团从绑架集团“飞鱼骑士”以及马可罗海贼团手中救出在章鱼烧店工作时很照顾她的老板八仔，一行人来到飞鱼骑士团的大本营后意外发现海咪口中的八仔是原·恶龙海贼团干部‘六刀流’小八，而“飞鱼骑士”首领‘铁面具’迪巴鲁似乎和草帽海贼团有着什么深仇大恨。在与飞鱼骑士团的战斗中，路飞一脚踢开了迪巴鲁的铁面具，没想到他竟然因为和山智悬赏单上的脸长得几乎一模一样，才会因此遭到海军的追杀，最后在山智“整形踢”下将迪巴鲁整形成一个帅哥，飞鱼骑士团就此和路飞一行人化敌为友。
第二季伟大航路之香波地諸島
第二季伟大航路女儿岛篇女儿岛篇（动画：408－421话）路飞被大熊传送到女儿岛亚马逊·百合，路飞食物中毒，并为雏菊及同伴所救。但因他不知女人岛上不准男人靠近的规定，且“劫持”了雏菊而遭到追杀，而后更在那遇上了自称因为“诅咒”而拥有“石化”能力的女性王下七武海‘海贼女帝’波雅·汉考克．
面对这个狠心把自己人石化的美艳暴君、目击此事却无动于衷的女人国子民、以及两位同样自称受诅咒其实是吃了恶魔果实的女王之妹，路飞展开了在女儿岛的战斗，后化解了与女儿岛居民的冲突和女帝的心结后，路飞无意中从纽婆婆那得知艾斯的困境，决定去深海监狱“因佩尔”拯救即将被处死的‘火拳’艾斯。而此时汉考克因暗恋上路飞，所以决定利用七武海身份暗中帮助他。另外，本篇也短暂说明了在路飞来到女儿岛的同时草帽海贼团其他同伴的去向。