建设项目组织机构管理与企业组织机构管理是局部与整体的关系。
组织机构设置的目的是为了充分发挥项目管理功能，提高项目整体管理水平，达到项目管理的最终目标。因此企业在项目管理中合理设置项目管理组织机构是一个至关重要的问题，高效的组织机构的建立是建设项目管理成功的组织保证。首先要建立一个能完成管理任务，使项目经理指挥灵便、运转自如、工作高效的组织机构——项目经理部。其目的就是为了提供进行建设项目管理的组讧E，一个好的组织机构，可以有效地完成建设项目管理目标，有效地应付各种环境的变化，形成组织力，使组织系统正常运转，产生集体思想和集体意识，完成项目经理部的管理任务。
项目经理部能否正常运转，首先是项目经理的人选问题。选择什么人担任项目经理，视建设项目的具体需要，不同的项目需要不同的项目经理。项目经理应具备一定的素质：领导才能、政治素质、理论水平、实践经验等各方面的才能。
2、建设项目质量管理
1)建立质量保证体系。为全面系统地把质量工作落到实处，首要任务是建立切实可行的质量保证体系，施工企业依据质量保证体系，建立自己的质量保证系统，编写质量手册，制定质量方针、质量目标。并使之具有系统性、协调性、可操作性和可检查性。
2)人、材料、机械的控制。人是质量的创造者。质量控制应以人为核心，把人作为控制的动力，调动人的积极性、创造性，增加人的责任感，树立质量第一的观念。材料是构成建筑产品的主体。在建设项目中，对材料的质量控制是至关重要的。机械是实现施工的重要手段，是建设项目中必不可少的因素。它对建设项目的进度、质量有着直接的影响。因此选好、用好机械设备至关重要。
3、建设项目的成本管理
随着建设项目管理在建筑业中逐步推广，项目的成本管理也逐渐被人们所重视，并且已经得到应用。可以说，项目成本管理已成为建设项目管理向深层次发展的主要标志，因为它能够体现建设项目管理的本质特征，能够反映建设项目管理的核心内容，能够提供衡量建设项目管理效绩的客观尺码。
制定建设项目成本管理的措施：建设项目成本的控制，不仅是专业成本人员的责任，也是项目管理人员，特别是项目经理的责任。要按照自己的业务分工负责。围绕生产经营这个中心开展工作。要建立以项目经理为核tL,的项目成本控制体系，实行项目经理负责制，就是要求项目经理对施T进度、质量、成本、安全和现场管理标准化全面负责，特别要把成本的控制放在首位。
建立项目成本管理责任制：项目管理人员的成本责任，不同于工作责任，工作责任的完成不等于成本责任的完成。如：单方强调质量，忽视了成本，单方做到供货及时，但忽视昂贵的价格等。因此在完成工作责任的同时，还应考虑成本责任的实施，进一步明确成本管理责任，使每个管理者都具有成本管理意识，做到精打细算。
4、建设项目安全生产与文明施工管理
所谓建设项目安全管理，就是建设项目在施工过程中，组织安全生产的全部活动，通过对生产因素的具体控制，使生产因素不安全的行为和状态减少或消除，不引发事故，从而保证建设项目的正常运行。
1)坚持安全管理原则即坚持安全与生产同步。管生产必须抓安全，安全寓于生产之中，并对生产具有促进与保障的作用。坚持“四全”动态管理，安全工作不是少数人和安全机构的事，而是一切与生产有关的人的共同事情，缺乏全员的参与，安全管理不会有生机，效果也不会明显。生产组织者在安全管理中的作用固然重要，全员性参与安全管理也是十分重要的。因此，生产活动中对安全工作必须是全员、全过程、全方位、全天候的动态管理。
2)坚持控制人的不安全行为与物的不安全状态。分析事故的成因，人、物和环境因素的作用是事故的根本原因，从对人和物的管理方面去分析事故，人的不安全行为和物的不安全状态，都是酿成事故的直接原因。
3)制定安全管理措施。加强建设项目的安全管理，制定切实可行的安全管理制度和措施十分重要。它是管理的方法和手段，对生产各因素状态的约束和控制，根据施工生产的特点，安全管理也具有明显的行业特色。要落实安全责任，实施责任管理，加强安全教育，例行安全检查。
明确施工管理制度，做到按专业、岗位、区域等包干负责。在建设项目中对现场各个方面专业的管理，开展文明施工竞赛活动，有布置、有检查、有考评、有奖惩，评比结果公布于众。