2、在防辐射标签上不同：不动产证有防辐射标签，而房产证没有防辐射标签;
3、两者的发证机关不同：不动产真的发证机关是不动产登记机构，这个机构是经过县级以上人民政府依法确定的、统一负责不动产登记工作的不部门;而房产证的发证机关是市房地产管理局或者市人民政府;
4、不动产证和房产证在版本上也有差异：房产证只有一种版本，而不动产证有两种，包括了单一版和集成版。单一版的意思是一个证书上只记载了一种不动产权力;集成版的意思是一个人在当地有多个不动产，所以享有了多个不动产权利，这些权利记载在一个不动产权证上，所以叫集成版。
二、二者区别的法律依据
《不动产登记暂行条例》
规定:不动产以不动产单元为基本单位进行登记。不动产单元具有唯一编码。不动产登记机构应当按照国务院国土资源主管部门的规定设立统一的不动产登记簿。不动产登记簿应当记载以下事项：
(一)不动产的坐落、界址、空间界限、面积、用途等自然状况;
(三)涉及不动产权利限制、提示的事项;
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不动产证上是儿子的名字，但房子是父母买的，儿子已经成年，父母欠别人的欠款，债主扣了欠款人儿子的不动产证，合理合法吗？
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