第二条本暂行办法所称市财政性资金投资基本建设项目工程价款，是指市直机关、企事业等单位使用市财政性资金，全额或部分投资基本建设项目，并依据承包合同约定支付的工程预付款、工程进度款和工程竣工价款等。
第三条财政性资金投资基本建设项目的工程价款计量与支付活动，应当遵循合法、平等、诚信的原则，并符合国家有关法律、法规和政策。
第二章工程合同价款的约定与调整
第四条建设单位与承包单位在签订施工承包合同时，对于工程价款的约定，建设工程应根据《东莞市建设工程招标投标管理办法》(东府[2003]103号)的有关规定采用固定总价合同方式，即以中标价并按招标文件、设计图纸内容一次包干。因特殊情况需采用固定单价合同方式或可调价格合同方式的施工项目，必须按程序报市政府批准。
第五条建设单位与承包单位必须严格履行合同有关工程价款的约定，在合同履行过程中不得再订立违反招投标文件和合同文件实质性内容的其他协议和签证；如因特殊情况确要对合同文件的内容作实质性修改的，必须按程序报批。
第六条工程合同价款发生调整时，承包单位应在合同规定的调整情况发生后14天内，将调整原因、内容、金额以书面形式通知建设单位，建设单位按规定程序进行审核，符合支付条件的可与工程进度款同期支付，竣工结算时再按合同条款及有关规定重新审核，作为调整合同价款的依据。
第七条工程设计变更价款的调整
(一)施工中发生工程变更，承包单位应按照建设单位批准的变更设计文件，进行变更施工。
(二)在工程设计变更确定后14天内，设计变更涉及工程价款调整的，由承包单位向建设单位提出，建设单位应按以下规定经批准后才能调整合同价款。
1、建设单位应成立专门机构，负责审核工程变更方案，确定具体处理措施，审批概算(或预算)
内50万元以下的工程变更项目，审核50万元(含50万元)以上的工程变更并报市主管领导审批。
2、工程变更价款的调整方法：
(1)合同中已有适用于变更工程的价格，按合同已有的价格变更合同价款；
(2)合同中只有类似于变更工程的价格，可以参照类似价格变更合同价款；
3、工程变更造成措施项目发生变化的，由市建设局会同市财政局制定措施项目费的调整方法，调整方法应在合同文件中明确。
(三)合同内设计变更工程是合同承包范围不可分割的一部分，承包单位应按建设单位提交的变更工程设计图纸完成施工。
第八条在签发中标通知书前，建设单位应对拟中标单位的工程量清单报价进行审核(如建设单位技术力量不足，可委托招标代理或造价咨询中介机构审核)，出具审核意见并抄送市建设工程造价管理站、市财政投资审核中心备案，发现属于严重不平衡报价的应要求拟中标单位进行适当修正，作为工程变更项目结算计价的依据。如不修正报价的，可认为拟中标单位放弃其中标资格。
工程变更价款确定时，发现所适用或参照的清单项目报价属于严重不平衡报价的应当进行修正，具体修正方法由市财政局会同市建设局制定。
第三章工程签证管理
第十条工程签证是工程合同价款调整的重要依据之一。工程签证是指建设单位与承包单位
在履行合同过程中发生工程变更、索赔等事件涉及合同价款的调整，按合同协议的约定双方达成一致处理意见的补充协议行为，包括设计变更、现场变更、索赔等形式。经双方书面确认的签证资料才能成为工程结算的依据。承包单位提交变更工程价款报告时必须附有工程签证资料。
第十一条建设单位进行工程变更时，应事先实行技术经济分析，优化变更方案。涉及规范、标准重大改变以及建设规模调整的工程变更，需按规定程序报建设项目原审批部门批准后方可施工。
第十二条工程签证管理要求
(一)建设单位应制订办理工程签证的内控程序，并将其作为本单位基建财务管理的重要内容之一。
(二)按照相互控制原则，建设单位对工程签证的管理，应设置三个或以上岗位进行控制，并明确岗位职责权限，做到执行、审核与审批相分离，确保办理工程签证业务的不相容岗位形成相互监督。
(三)工程签证资料管理应与项目建设同步进行，严格按基建档案管理的要求进行归档。建设、监理、施工单位要有专人管理工程签证等资料档案。签证资料的审核人与保管人应由不同人员担任，签证资料应安全保管。
(四)建设单位应建立工程签证问责制度，实行责任追究，防止工程管理人员弄虚作假，高估冒算。
第十三条工程签证内容及形式要求
(一)合同协议、招标文件中已明确包含在招标范围之内而实际上没有施工或实际工程量减少的工程项目，应办理签证，调减工程价款。
(三)对局部拆除重建类工程变更项目，工程签证应记载拆除前工程所完成的阶段情况和当时的状况，并附有拆除前的图纸、照片；若拆除的材料、设备及已加工好但未安装的成品、半成品中可回收利用的残值是给承包单位处理的，工程签证应扣减相应的残值并给予说明；若可回收的残值估价扣除拆除费用后超过10万元的，建设单位应采用公开竞价方式实现残值回收规范化和最大化。
(四)由于地质勘察报告与实际情况不相符或设计失误、遗漏、粗糙，引起工程变更需要进行工程签证的，工程变更签证单必须经勘察、设计单位确认，造成投资增加的，应当追究勘察、设计单位的责任。对于工程签证金额超过50万元的，建设单位应当会同市财政局做好现场核实工作，确保工程签证的真实准确。
(五)除了由承包单位代购的材料设备和代付的款项外，建设单位原则上只在签证工程签证报告中签认工程数量，而不直接签认单价和金额。若为了便于管理和控制，可暂定签证事项的单价或总价，工程竣工结算时再调整。