一般纳税人购进农产品，取得小规模纳税人开具的1%税率的增值税专用发票，是否可以按照9%的扣除率计算抵扣进项税额
政策依据：
二、纳税人购进农产品，按下列规定抵扣进项税额：
(一)除本条第(二)项规定外，纳税人购进农产品,取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额;从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额;取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
(二)营业税改征增值税试点期间，纳税人购进用于生产销售或委托受托加工13%税率货物的农产品维持原扣除力度不变。
政策关键词：
以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额
实务答疑：
农产品抵扣进项总结(大连税务)
第一种情形：纳税人购进用于生产销售税率9%、6%货物服务的农产品。
01、取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税
02、从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税
专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额。
即：按票面注明的税额抵扣进项税额。
人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。
即：以不含税的“金额”计算进项税额。
03、取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
即：以免税的“金额”计算进项税额。
第二种情形：纳税人购进用于生产销售或委托加工13%税率货物的农产品按照10%的扣除率计算进项税额。
在领用农产品环节，如果农产品用于生产或者委托加工13%税率货物，则加计1%进项税额。比如，5月份购进一批农产品，购进时按照9%计算抵扣进项税额;6月份领用时，确认用于生产13%的税率货物，则在6月份再加计1%进项税额。
第三种情形：纳税人购进农产品既用于生产销售或委托受托加工13%税率货物又用于生产销售其他货物服务的。
应当分别核算用于生产销售或委托受托加工13%税率货物和其他货物服务的农产品进项税额。未分别核算的，统一以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额，或以农产品收购发票或销售发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
需要说明的是：
取得批发零售环节纳税人销售免税农产品开具的免税发票，以及小规模纳税人开具的增值税普通发票，均不得计算抵扣进项税额。
1%的征收率你真的用对了吗？
15.一般纳税人购进农产品，取得小规模纳税人开具的1%税率的增值税专用发票，是否可以按照9%的扣除率计算抵扣进项税额？
(二)营业税改征增值税试点期间，纳税人购进用于生产销售或委托受托加工17%税率货物的农产品维持原扣除力度不变。
……”
三、纳税人购进用于生产销售或委托加工16%税率货物的农产品，按照12%的扣除率计算进项税额。”
因此，自2020年3月1日至2020年12月31日，一般纳税人购进农产品，取得小规模纳税人开具的1%税率的增值税专用发票，可以按照9%的扣除率计算抵扣进项税额。