首先，让我们来了解一下烟草公司和烟草专卖局之间的关系。中国烟草专卖局和中国烟草总公司可以说是一个大家庭内的两个品牌。它们分别下辖各直属公司和各省级烟草公司，这些公司分为工业公司和商业公司。烟草专卖局主要负责维护烟草专卖制度，具备行政职能。而烟草公司通常被称为“xxx烟草专卖局（公司）”，主要承担行政职能的是烟草专卖局（公司）内的专卖部门。总体而言，中国烟草体制实行了工商分离的形式，即生产和销售的分离。
接着，我们来分析一下中烟工业公司和烟草公司之间的区别。中烟工业公司是由多个烟厂合并而成的，主要从事卷烟生产，也就是负责烟草的生产。可以说它属于烟草的生产企业。而烟草公司/烟草专卖局的商业流通部分则与市场管理的烟草专卖局合并，组成了新的烟草专卖局（公司），主要负责烟草的专卖、烟叶的种植收购以及卷烟的销售。
简单来说，这两者的区别主要体现在以下几个方面：
1.卷烟厂是工业企业，专卖局是商业企业（未来可能会改制为工商局性质的政府部门）；
2.卷烟厂负责生产烟草，但不能销售（销售就属于违法行为），而专卖局则负责烟草的销售；
3.卷烟厂只能将自己生产的卷烟以调拨价卖给烟草局，然后烟草局将卷烟批发给广大个体零售户，最终由消费者购买。两者之间的关系不是竞争关系，而是一种利益关系的调整；
4.消费者不能直接到烟草局购买烟草，也不能到卷烟厂购买烟草；
5.烟草局将从农民手中购买的烟叶卖给卷烟厂，卷烟厂不能直接向农民购买烟叶；
6.不是每个地方都有卷烟厂，但烟草局每个县都会有分支机构；
7.卷烟厂是二级法人，而烟草局涵盖四个级别：国家烟草局、省级烟草局、市级烟草局和县级烟草局。
各级烟草局有相应的管辖范围，一般来说，国家烟草局负责管理烟厂和省级烟草局，省级烟草局管理市级烟草局，市级烟草局管理县级烟草局。只有市级烟草局及以上级别的机构才有资格直接从烟厂购进烟草进行销售，县级烟草局则没有这样的权限。