数据分析面向数据科学家和分析师的统计基础3D建模模拟仿真

“统计学是科学的语法。卡尔·皮尔逊

统计学在数据科学和数据分析中的重要性不容低估。统计提供了查找结构和提供更深入数据见解的工具和方法。统计学和数学都喜欢事实,讨厌猜测。了解这两个重要主题的基础知识将使您能够批判性地思考,并在使用数据解决业务问题和做出数据驱动的决策时具有创造力。在本文中,我将介绍以下数据科学和数据分析的统计主题:

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随机变量的概念构成了许多统计概念的基石。可能很难理解其正式的数学定义,但简单地说,随机变量是一种将随机过程的结果(例如掷硬币或掷骰子)映射到数字的方法。例如,我们可以通过随机变量X定义抛硬币的随机过程,如果结果是正面,则取值1,如果结果是反面,则取值0。

在这个例子中,我们有一个随机抛硬币的过程,这个实验可以产生两个可能的结果:{0,1}。这组所有可能的结果称为实验的样本空间。每次重复随机过程时,它被称为一个事件。在此示例中,掷硬币并获得尾巴作为结果是一个事件。该事件发生特定结果的几率或可能性称为该事件的概率。事件的概率是随机变量取特定值x的可能性,该值可以用P(x)描述。在掷硬币的例子中,正面或反面的可能性是相同的,即0.5%或50%。所以我们有以下设置:

在此示例中,事件的概率只能取[0,1]范围内的值。

要理解均值、方差和许多其他统计主题的概念,学习总体和样本的概念非常重要。总体是所有观测值(个体、对象、事件或过程)的集合,通常非常大且多样化,而样本是总体观测值的子集,理想情况下是总体的真实表示。

也称为平均值,是一组有限数字的中心值。假设数据中的随机变量X具有以下值:

其中N是样本集中的观测值或数据点的数量,或者只是数据频率。那么由?(通常用于近似总体均值)定义的样本均值可以表示如下:

平均值也称为期望值,通常由E()或顶部带有条形的随机变量定义。例如,随机变量X和Y(即E(X)和E(Y))的期望可以表示如下:

importnumpyasnpimportmathx=np.array([1,3,5,6])mean_x=np.mean(x)#incasethedatacontainsNanvaluesx_nan=np.array([1,3,5,6,math.nan])mean_x_nan=np.nanmean(x_nan)方差方差衡量数据点与平均值的分布距离,等于数据值与平均值(平均值)之差的平方和。此外,总体方差可以表示如下:

x=np.array([1,3,5,6])variance_x=np.var(x)#hereyouneedtospecifythedegreesoffreedom(df)maxnumberoflogicallyindependentdatapointsthathavefreedomtovaryx_nan=np.array([1,3,5,6,math.nan])mean_x_nan=np.nanvar(x_nan,ddof=1)要推导不同流行概率分布函数的期望和方差,请查看此Github存储库。

标准差只是方差的平方根,用于衡量数据与其平均值的差异程度。由sigma定义的标准差可以表示如下:

标准差通常优于方差,因为它与数据点具有相同的单位,这意味着您可以更轻松地解释它。

x=np.array([1,3,5,6])variance_x=np.std(x)x_nan=np.array([1,3,5,6,math.nan])mean_x_nan=np.nanstd(x_nan,ddof=1)协方差协方差是两个随机变量联合变异性的度量,描述了这两个变量之间的关系。它被定义为两个随机变量与其均值的偏差的乘积的期望值。两个随机变量X和Z之间的协方差可以用以下表达式描述,其中E(X)和E(Z)分别表示X和Z的均值。

协方差可以取负值或正值以及值0。协方差的正值表示两个随机变量倾向于在同一方向上变化,而负值表示这些变量在相反的方向上变化。最后,值0表示它们不会一起变化。

x=np.array([1,3,5,6])y=np.array([-2,-4,-5,-6])corr=np.corrcoef(x,y)概率分布函数描述随机变量在给定范围内(以最小和最大可能值为界)可以采用的所有可能值、样本空间和相应概率的函数称为概率分布函数(pdf)或概率密度。每个pdf都需要满足以下两个条件:

概率函数通常分为两类:离散和连续。离散分布函数描述了具有可数样本空间的随机过程,例如抛硬币的例子只有两种可能的结果。连续分布函数描述了具有连续样本空间的随机过程。离散分布函数的例子有伯努利、二项式、泊松、离散均匀。连续分布函数的示例包括正态分布函数、连续均匀分布函数、柯西分布函数。

二项分布是n个独立实验序列中成功次数的离散概率分布,每个实验都有布尔值结果:成功(概率为p)或失败(概率q=1?p)。假设随机变量X服从二项分布,那么在n个独立试验中观察到k个成功的概率可以用以下概率密度函数表示:

在分析重复独立实验的结果时,二项分布很有用,特别是如果对给定特定错误率达到特定阈值的概率感兴趣。二项分布均值和方差

下图可视化了二项分布的示例,其中独立试验的数量等于8,每个试验的成功概率等于16%。

例如,泊松分布可用于对晚上7点到10点之间到达商店的客户数量或晚上11点到12点之间到达急诊室的患者数量进行建模。下图可视化了泊松分布的示例,其中我们计算到达网站的Web访问者数量,其中假定到达率lambda等于7分钟。

#RandomGenerationof1000independentPoissonsamplesimportnumpyasnplambda_=7N=1000X=np.random.poisson(lambda_,N)#HistogramofPoissondistributionimportmatplotlib.pyplotaspltcounts,bins,ignored=plt.hist(X,50,density=True,color='purple')plt.title("RandomlygeneratingfromPoissonDistributionwithlambda=7")plt.xlabel("Numberofvisitors")plt.ylabel("Probability")plt.show()正态分布正态概率分布是实值随机变量的连续概率分布。正态分布,也称为高斯分布,可以说是社会和自然科学中通常用于建模目的的最流行的分布函数之一,例如,它用于对人的身高或考试分数进行建模。假设随机变量X服从正态分布,那么它的概率密度函数可以表示如下。

其中参数?(亩)分布的均值是否也称为位置参数、参数?(西格玛)是分布的标准差,也称为刻度参数。数字?(pi)是一个数学常数,大约等于3.14。正态分布均值和方差

下图可视化了一个正态分布示例,平均值为0(?=0),标准差为1(?=1),称为对称标准正态分布。

#RandomGenerationof1000independentNormalsamplesimportnumpyasnpmu=0sigma=1N=1000X=np.random.normal(mu,sigma,N)#Populationdistributionfromscipy.statsimportnormx_values=np.arange(-5,5,0.01)y_values=norm.pdf(x_values)#SamplehistogramwithPopulationdistributionimportmatplotlib.pyplotaspltcounts,bins,ignored=plt.hist(X,30,density=True,color='purple',label='SamplingDistribution')plt.plot(x_values,y_values,color='y',linewidth=2.5,label='PopulationDistribution')plt.title("Randomlygenerating1000obsfromNormaldistributionmu=0sigma=1")plt.ylabel("Probability")plt.legend()plt.show()贝叶斯定理贝叶斯定理或通常称为贝叶斯定律可以说是最强大的概率和统计规则,以英国著名统计学家和哲学家托马斯贝叶斯的名字命名。

条件概率的概念在贝叶斯理论中起着核心作用,它是在另一个事件已经发生的情况下,一个事件发生的概率的度量。贝叶斯定理可以用以下表达式来描述,其中X和Y分别代表事件X和Y:

Pr(X|Y):假设事件或条件Y已经发生或为真,事件X发生的概率Pr(Y|X):假设事件或条件X已经发生或为真,事件Y发生的概率Pr(X)和Pr(Y):分别观测事件X和Y的概率

在前面的例子中,以达到特定年龄为条件感染冠状病毒(事件X)的概率为Pr(X|Y),这等于在某个年龄感染冠状病毒的情况下获得冠状病毒的概率,Pr(Y|X),乘以感染冠状病毒的概率Pr(X),除以处于特定年龄的概率Pr(Y)。

早些时候,引入了变量之间因果关系的概念,当一个变量对另一个变量产生直接影响时,就会发生这种情况。当两个变量之间的关系是线性的时,线性回归是一种统计方法,可以帮助模拟变量(自变量)中的单位变化对另一个变量(因变量)的值的影响。

因变量通常称为响应变量或解释变量,而自变量通常称为回归变量或解释变量。当线性回归模型基于单个自变量时,该模型称为简单线性回归,当模型基于多个自变量时,它称为多元线性回归。简单线性回归可以用以下表达式来描述:

其中Y是因变量,X是作为数据一部分的自变量,?0是未知且常数的截距,?1是斜率系数或对应于未知且常数的变量X的参数。最后,u是模型在估计Y值时产生的误差项。线性回归背后的主要思想是通过一组配对(X,Y)数据找到最拟合的直线,回归线。线性回归应用程序的一个示例是模拟鳍状肢长度对企鹅体重的影响,如下所示。

#Rcodeforthegraphinstall.packages("ggplot2")install.packages("palmerpenguins")library(palmerpenguins)library(ggplot2)View(data(penguins))ggplot(data=penguins,aes(x=flipper_length_mm,y=body_mass_g))+geom_smooth(method="lm",se=FALSE,color='purple')+geom_point()+labs(x="FlipperLength(mm)",y="BodyMass(g)")具有三个自变量的多元线性回归可以用以下表达式描述:

普通最小二乘法(OLS)是一种在线性回归模型中估计未知参数(如?0和?1)的方法。该模型基于最小二乘原理,该原理最小化观测因变量与其由自变量的线性函数预测的值(通常称为拟合值)之间的差值的平方和。因变量Y的实际值和预测值之间的这种差异称为残差,OLS的作用是最小化残差平方和。此优化问题导致未知参数?0和?1的以下OLS估计值,这些参数也称为系数估计值。

估计简单线性回归模型的这些参数后,响应变量的拟合值可以按如下方式计算:

残差或估计误差项可按如下方式确定:

请务必记住误差项和残差之间的差异。从不观察误差项,而残差是根据数据计算的。OLS估计每个观测值的误差项,但不估计实际误差项。因此,真正的误差方差仍然未知。此外,这些估计数受到抽样不确定性的影响。这意味着我们将永远无法从经验应用中的样本数据中确定这些参数的确切估计值,即真实值。但是,我们可以通过使用残差计算样本残差来估计它,如下所示。

此样本残差方差估计值有助于估计估计参数的方差,通常表示如下:

此方差项的平方根称为估计值的标准误,它是评估参数估计值准确性的关键组成部分。它用于计算测试统计量和置信区间。标准误差可以表示如下:

估计器的偏差是其期望值与被估计参数的真实值之间的差值,可以表示如下:

无偏性不能保证任何特定样本获得的估计值等于或接近?。这意味着,如果从总体中反复抽取随机样本,然后每次计算估计值,那么这些估计值的平均值将等于或非常接近β。

高斯-马尔可夫定理中的“最佳”一词与估计量的方差有关,称为效率。一个参数可以有多个估计量,但方差最小的估计量称为有效估计量。

术语一致性与术语样本大小和收敛性齐头并进。如果当样本量变得非常大时,估计器收敛到真实参数,则称此估计器是一致的,即:

所有这些性质都适用于高斯-马尔可夫定理中总结的OLS估计。换句话说,OLS估计具有最小的方差,它们是无偏的,参数是线性的,并且是一致的。这些属性可以通过使用前面的OLS假设进行数学证明。

置信区间是包含具有特定预先指定概率的真实总体参数的范围,称为实验的置信水平,它是通过使用样本结果和边际误差获得的。

边际误差是样本结果之间的差异,并且基于如果使用整个总体的结果。

置信水平描述了实验结果的确定性水平。例如,95%的置信水平意味着,如果重复执行相同的实验100次,那么这95次试验中的100次将产生类似的结果。请注意,置信水平是在实验开始之前定义的,因为它会影响实验结束时的误差幅度。

如前所述,简单线性回归的OLS估计值、截距?0和斜率系数?1的估计值受到采样不确定性的影响。但是,我们可以为这些参数构建置信区间,它将在所有样本的95%中包含这些参数的真实值。也就是说,95%置信区间?可以解释如下:

它基于参数估计值、该估计值的标准误差以及表示对应于1%拒绝规则的边际误差的值96.5。此值是使用正态分布表确定的,本文稍后将对此进行讨论。同时,下图说明了95%置信区间的概念:

请注意,置信区间也取决于样本数量,因为它是使用基于样本数量的标准误差计算的。

在统计学中检验假设是一种测试实验或调查结果以确定结果的意义的方法。基本上,人们通过计算结果偶然发生的几率来测试获得的结果是否有效。如果是字母,那么结果不可靠,实验也不可靠。假设检验是统计推断的一部分。

首先,您需要确定要检验的论文,然后您需要制定零假设和备择假设。该检验可以有两种可能的结果,根据统计结果,您可以拒绝或接受所述假设。根据经验,统计学家倾向于将假设的版本或表述置于需要拒绝的零假设下,而可接受的和期望的版本则在备择假设下陈述。

让我们看一下前面提到的示例,其中线性回归模型用于调查企鹅的自变量鳍状肢长度是否对因变量身体质量产生影响。我们可以用下面的统计表达式来表述这个模型:

然后,一旦估计了系数的OLS估计值,我们就可以制定以下零假设和备择假设来检验鳍状肢长度是否对体重有统计上的显着影响:

其中H0和H1分别表示原假设和备择假设。拒绝原假设意味着鳍状肢长度增加一个单位会对体重产生直接影响。假设参数估计值?1描述了自变量鳍状肢长度对因变量BodyMass的这种影响。这个假设可以重新表述如下:

其中H0表示参数估计值?1等于0,即鳍状肢长度对体重的影响在统计上不显著,而H0表示参数估计值?1不等于0,表明鳍状肢长度对体重的影响在统计上显著。

在执行统计假设检验时,需要考虑两种概念类型的误差:类型I错误和类型II错误。当错误地拒绝Null时,会发生类型I错误,而当错误地未拒绝Null假设时,会发生类型II错误。混淆矩阵可以帮助清楚地可视化这两种类型的错误的严重性。

根据经验,统计学家倾向于将假设的版本置于需要拒绝的零假设下,而可接受的和期望的版本则在备择假设下陈述。

陈述Null和备择假设并定义检验假设后,下一步是确定哪个统计检验是合适的并计算检验统计量。是否拒绝Null可以通过将检验统计量与临界值进行比较来确定。此比较显示观测检验统计量是否比定义的临界值更极端,并且可以产生两种可能的结果:

临界值基于预先指定的显著性水平?(通常选择等于5%)和检验统计量遵循的概率分布类型。临界值将该概率分布曲线下的面积划分为拒绝区域和非拒绝区域。有许多统计检验用于检验各种假设。统计检验的例子有学生t检验、F检验、卡方检验、德宾-豪斯曼-吴内生性检验、W海特异方差检验。在本文中,我们将研究其中两个统计测试。

当错误地拒绝Null时,会发生类型I错误,而当错误地未拒绝Null假设时,会发生类型II错误。

最简单和最受欢迎的统计检验之一是学生t检验。可用于测试各种假设,尤其是在处理假设时,其中主要感兴趣的领域是找到单个变量的统计显着效应的证据。t检验的检验统计量服从学生的t分布,可按如下方式确定:

其中,提名器中的h0是测试参数估计值所依据的值。因此,t检验统计量等于参数估计值减去假设值除以系数估计值的标准误。在前面所述的假设中,我们想测试鳍状肢长度是否对体重有统计学意义的影响。可以使用t检验执行此检验,在这种情况下,h0等于0,因为斜率系数估计值是针对值0检验的。

t检验有两个版本:双侧t检验和单侧t检验。是否需要前一个版本或后一个版本的检验完全取决于要检验的假设。

当假设在类似于以下示例的原假设和备择假设下检验相等与不相等关系时,可以使用双侧或双尾t检验:

双侧t检验有两个排斥区域,如下图所示:

在此版本的t检验中,如果计算的t统计量太小或太大,则拒绝Null。

在这里,根据样本数量和所选显著性水平将检验统计量与临界值进行比较。要确定截止点的确切值,可以使用双侧t分布表。当假设在原假设和备择假设下检验正/负与负/正关系时,可以使用单侧或单尾t检验,类似于以下示例:

单侧t检验具有单个拒绝区域,根据假设侧,拒绝区域位于左侧或右侧,如下图所示:

在此版本的t检验中,如果计算的t统计量小于/大于临界值,则拒绝Null。

F检验是另一种非常流行的统计检验,通常用于检验检验多个变量的联合统计显著性的假设。当您要测试多个自变量是否对因变量具有统计显著影响时,就是这种情况。下面是可以使用F检验检验的统计假设的示例:

其中Null表示对应于这些系数的三个变量在统计意义上共同不显著,而备择表示这三个变量在统计意义上共同显著。F检验的检验统计量服从F分布,可以按如下方式确定:

F检验具有单个排斥区域,如下所示:

如果计算出的F统计量大于临界值,则可以拒绝Null,这表明自变量在统计意义上共同显著。拒绝规则可以表示如下:

确定是否定或支持原假设的另一种快速方法是使用p值。p值是Null下条件发生的概率。换个说法,p值是假设原假设为真,观察到结果至少与检验统计量一样极端的概率。p值越小,反对原假设的证据越强,表明它可以被否定。

p值的解释取决于所选的显著性水平。大多数情况下,1%、5%或10%的显著性水平用于解释p值。因此,这些检验统计量的p值可用于检验相同的假设,而不是使用t检验和F检验。

下图显示了具有两个自变量的OLS回归的示例输出。在此表中,t检验的p值(检验class_size变量参数估计值的统计显著性)和F检验的p值(检验class_size的联合统计显著性)和el_pct变量参数估计值下划线。

对应于class_size变量的p值为0.011,将此值与显著性水平1%或0.01、5%或0.05、10%或0.1进行比较时,可以得出以下结论:

因此,此p值表明class_size变量的系数在5%和10%显著性水平下具有统计显著性。对应于F检验的p值为0.0000,并且由于0小于所有三个临界值;0.01,0.05,0.10,我们可以得出结论,在所有三种情况下,F检验的Null都可以被拒绝。这表明class_size变量和el_pct变量的系数在1%、5%和10%显著性水平上具有共同统计显著性。

虽然,使用p值有很多好处,但它也有局限性。也就是说,p值取决于关联量级和样本数量。如果效应的量级较小且在统计意义上不显著,则p值可能仍显示显著影响,因为大样本数量很大。反之亦然,效应可能很大,但如果样本量较小,则无法满足p<0.01、0.05或0.10标准。

大数定律(LLN)和中心极限定理(CLM)在推论统计中都起着重要作用,因为它们表明,当数据足够大时,无论原始总体分布的形状如何,实验结果都成立。收集的数据越多,统计推断就越准确,因此生成的参数估计值就越准确。

LLN)假设X1,X2,...,Xn都是具有相同底层分布的独立随机变量,也称为独立相同分布或i.i.d,其中所有X都具有相同的平均值?和标准差?。随着样本数量的增加,所有X的平均值等于平均值的概率?等于1。大数定律可以概括如下:

假设X1,X2,...,Xn都是具有相同底层分布的独立随机变量,也称为独立相同分布或i.i.d,其中所有X都具有相同的平均值?和标准差?。随着样本数量的增加,X的概率分布收敛于正态分布中的均值?和方差?平方。中心极限定理可以总结如下:

换句话说,当你有一个有平均值的人口时?和标准差?并且您从该总体中抽取足够大的随机样本并进行替换,则样本均值的分布将近似正态分布。

降维是将数据从高维空间转换为低维空间,使得数据的这种低维表示仍然尽可能多地包含原始数据的有意义属性。

分析主成分分析或PCA是一种降维技术,通常用于降低大型数据集的维数,方法是将大量变量转换为仍包含原始大型数据集中大部分信息或变体的较小数据集。

假设我们有一个带有p个变量的数据X;X1,X2,....,Xp与特征向量e1,...,ep,和特征值?1,...,p.特征值显示特定数据字段在总方差中解释的方差。PCA背后的想法是创建新的(自变量)变量,称为主成分,它们是现有变量的线性组合。第i个主成分可以表示如下:

然后,使用肘部规则或Kaiser规则,您可以确定在不丢失太多信息的情况下以最佳方式汇总数据的主分量的数量。查看每个主成分解释的总变异比例(PRTV)也很重要,以确定包括或排除它是否有益。第i个主成分的PRTV可以使用特征值计算,如下所示:

肘部规则或肘部法是一种启发式方法,用于根据PCA结果确定最佳主成分的数量。该方法背后的思想是将解释的变异绘制为分量数的函数,并选择曲线的弯头作为最佳主分量的数量。下面是此类散点图的示例,其中PRTV(Y轴)绘制在主分量的数量(X轴)上。弯头对应于X轴值2,这表明最优主成分的数量为2。

其中X是p个变量和N个观测值的[pxN]矩阵,μ是[pxN]总体均值矩阵,A是[pxk]公因子载荷矩阵,F[kxN]是公因子矩阵,u[pxN]是特定因子矩阵。因此,换句话说,因子模型是一系列多元回归,根据不可观察的公共因子fi的值预测每个变量Xi:

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